Bioenv 分析通過 計算樣本群落結構的距離矩陣和 環境因子的距離矩陣,計算兩個距離之間的相關系數,挑選出最佳的環境因子組合; 默認情況下,計算 群落結構的距離矩陣時, 使用 Bray-Curtis 距離; 計算環境因子的距離矩陣時,使用Euliodean 歐式距離 ...
Adonis 分析 是基於距離矩陣的多變量方差置換分析, 代碼示例: 默認使用bray 距離來計算樣本間的距離矩陣 參考資料: https: www.rdocumentation.org packages vegan versions . topics adonis https: pdfs.semanticscholar.org e b aa f afdea edf f d.pdf ...
2017-12-18 10:51 0 2452 推薦指數:
Bioenv 分析通過 計算樣本群落結構的距離矩陣和 環境因子的距離矩陣,計算兩個距離之間的相關系數,挑選出最佳的環境因子組合; 默認情況下,計算 群落結構的距離矩陣時, 使用 Bray-Curtis 距離; 計算環境因子的距離矩陣時,使用Euliodean 歐式距離 ...
這周的作業我開始得好遲啊。。。然而還是要努力做啊。。。 ××××××××××××××我是萌萌噠分割線×××××××××××××××××××××××××××××××××××× 首先,百度進入官方頁面,看到這些: 也就是說,需要先安裝permute和lattice包。那么,如何安裝 ...
vegan 包是進行群落數據分析最常用的R包,其中的 specaccum 函數用來計算物種的累計曲線 首先看下官方示例: 出來的結果圖如下: 那么這幅圖表明了什么含義呢? 首先看下輸入數據 我們簡單的看一下BCI這個數據,它的每一行代表了一個樣本,不同樣 ...
程序經常出現OOM錯誤,然后關鍵字"go pprof"搜到文章<Go程序性能分析pprof>,該文章第二步說運行程序后會生成profile文件,但是編譯運行后發現生成的profile文件大小一直為0,然后關鍵字"go pprof profile is empty"搜到文章 ...
寫在前面:現今絕大多數的網站都使用js來加載數據,傳統的請求方法很難再奏效,對動態數據的爬取現在大都分為兩類爬取方法: 1. 使用Selinium等自動化測試軟件去模擬瀏覽器,這種方法幾乎可以適用於所有網站,但是缺點是效率速度太慢了,如果有別的爬取方法,優先采用其他。 2. 對網頁直接進行抓包 ...
randomForest 包提供了利用隨機森林算法解決分類和回歸問題的功能;我們這里只關注隨機森林算法在分類問題中的應用 首先安裝這個R包 安裝成功后,首先運行一下example 通過查看函數的幫助文檔,可以看到對應的example ...
准備工具 : 1 Charles : https://www.charlesproxy.com (收費) 2 夜神模擬器 : https://www.yeshen.com (免費 ...
最近總是有需要單獨對某一個類型的通路進行超幾何分布的p值計算,這里記錄一下python包的計算方法 使用scipy的stat里面的hypergeom.sf方法進行富集分析的p值計算 hsaxxxxx AA and Linoleic metabolism KEGG pathways ...