ROSETTA使用技巧隨筆--RosettaLigand Docking
時間不充分，簡單記錄下自己實踐過程中的做法: 1. 首先，非標准殘基都需要轉換成.params文件，使用 <path-to-Rosetta>/main/source/scripts/python/public/molfile_to_params.py -n TPP TPP.mol2 ...
原文：ROSETTA使用技巧隨筆--蛋白蛋白對接
先寫簡略版，以后再詳細寫。 . 對輸入結構進行預處理 refine gt relax.default.linuxgccrelease in:file:s input files from rcsb qys.pdb flag input relax flag input relax: . local dock 執行局部對接之前應手動把受體和配體放到一個pdb文件中，用不同的鏈標注 例如A，B ，相距 ...
2017-11-10 16:18 2 2544 推薦指數：
相關推薦
【3】蛋白鑒定軟件之Mascot
目錄 1.簡介 2.配置 2.1在線版本 2.2 服務器版本 3.運行 3.1 在線版本 3.2 服務器版本 4.結果 1.簡介 Mascot是非常經典的蛋白鑒定軟件，被Frost ...
使用Modeller對蛋白質進行同源建模
一、modeller下載與安裝 輸入key碼：MODELIRANJE 做下Basic Modeling 流程吧： 在python環境下運行下例 ...
【2】蛋白鑒定軟件之Comet
目錄 1.簡介 2.下載安裝 3.軟件使用 4.結果 1.簡介 官網：http://comet-ms.sourceforge.net/ 1993年開發，持續更新，免費開源 適用Windows/Linux 多線程，支持多種輸入輸出 ...
蛋白組DIA分析：Spectronaut軟件使用指南
官方文檔： https://biognosys.com/media.ashx/spectronautmanual.pdf 0. 准備 Spectronaut軟件是蛋白組DIA分析最常用的譜圖解析軟件之一，優點是定量准確，缺點是高額收費，window版本，速度慢。一起來簡單了解下用法 ...
【1】蛋白鑒定軟件之X!Tandem
目錄 1. 簡介 2.下載安裝 3. 軟件試用 4. 結果 5. FAQ 1. 簡介 X!Tandem是GPM：The Global Proteome Machine（主要基於Web的開源用戶界面，用於分析和顯示蛋白質鑒定數據。關於GPM的更多 ...
高蛋白減肥法
方案： 🌟早：乳清蛋白粉30g+膳食纖維10g+溫水300ml+多種維生素1粒+魚油1粒 🌟加餐：500-800ml水 🌟中：主食25g+蛋白質類食物100g+蔬菜250g 🌟加餐：乳清蛋白粉30g+膳食纖維10g+溫水300ml 🌟晚：主食25g+蛋白質類食物100g+蔬菜 ...
蛋白質結構模型和功能預測：I-TASSER工具的使用
I-TASSER是一款用於預測蛋白質結構和功能的工具，網站鏈接：https://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/ 具體描述如下： I-TASSER (Iterative Threading ASSEmbly Refinement ...