散點圖 數據點在直角坐標系平面上的分布圖。在宏基因組領域,散點圖常用於展示樣品組間的Beta多樣性,常用的分析方法有主成分分析(PCA),主坐標軸分析(PCoA/MDS)和限制條件的主坐標軸分析(CPCoA/CCA/RDA)。 Beta ...
擴增子常見問題 實驗室檢測的DNA濃度很高,送到公司檢測之后濃度卻比較低呢 老師在實驗室多采用Nanodrop對DNA濃度進行檢測,而在公司我們會結合Qubit Nanodrop 瓊脂糖電泳三種方法檢測DNA樣品的質量 由於不同檢測方法的原理不同,所以檢測出的結果也會存在一定的差異。其中,Nanodrop檢測法是基於紫外分光光度原理進行檢測,由於DNA樣品中可能含有部分雜質,因此會造成結果虛高的 ...
2017-08-03 00:13 0 3044 推薦指數:
散點圖 數據點在直角坐標系平面上的分布圖。在宏基因組領域,散點圖常用於展示樣品組間的Beta多樣性,常用的分析方法有主成分分析(PCA),主坐標軸分析(PCoA/MDS)和限制條件的主坐標軸分析(CPCoA/CCA/RDA)。 Beta ...
宏基因組測序: 濃度>=50ng/ul OD260/280:1.8-2.0 DNA兩次需要量>=3ug 宏基因組測序需要提供什么樣品要求? (1)提供環境微生物的基因組DNA或者擴增產物,OD值在1.8 ...
https://mp.weixin.qq.com/s/xsL9GuLs7b3nRF8VeRtinQ http://www.sohu.com/a/146620511_769248 宏基因組測序(MetagenomicsSequencing)是對環境樣品中全部微生物的總DNA(也稱宏基因組 ...
作為一種增加有限DNA量的方法,全基因組擴增技術於1992年出現,該方法特別適於法醫學鑒定和遺傳疾病的研究,以及如二代測序技術和CGH陣列(比較基因組雜交)等新技術應用,后者的主要難題就在於DNA樣本數量有限,但分析需求量又很可觀。目前業界已經開發出多種WGA技術,它們之間的實驗 ...
PacBio公司的業務范圍也就5個(官網): Whole Genome Sequencing Targeted Sequencing Complex Populations RNA Sequencing Epigenetics 其中全基因組測序應該是PacBio ...
文章鏈接:http://biorxiv.org/content/early/2016/10/15/081141 作者:Yee Voan Teo, Nicola Neretti 時間:2016.10.15 摘要: 許多宏基因組分類工具在宏基因組學領域 ...
描述 MetaPhlAn是分析從物種水平分辨率宏基因組鳥槍法測序數據的微生物群落(細菌,古細菌,真核細胞和病毒)的組成的計算工具。從版本2.0,MetaPhlAn還能夠確定具體的菌株(在將樣品含有先前測序的菌株的不那么頻繁的情況下),並跟蹤跨越樣品菌株的所有物種。 MetaPhlAn 2依靠 ...
華大的春季培訓課程之一:https://ke.qq.com/course/1128997?taid=7160092735650341,我認為講得很好,介紹全面而詳細,加了一些個人經驗(侵刪)。 ...