全基因組重測序基礎及高級分析知識匯總 oddxix 已關注 2018.09.20 17:04 字數 11355 閱讀 212評論 0喜歡 6 轉自:http://www.360doc.com/content/18/0208/11 ...
Original 曾健明生信技能樹 這里選取的是GATK best practice是目前認可度最高的全基因組重測序分析流程,尤其適用於人類研究。 PS:其實本文應該屬於直播我的基因組系列,有兩個原因把它單獨拿出來, 首先,直播我的基因組閱讀量太低了,可能是大家覺得錯過了前面的,后面的看起來沒有必要,這里我可以肯定的告訴大家,這一講是獨立的,而且是全流程,你學好了這個,整個直播我的基因組就可以不 ...
2017-07-01 23:49 0 10268 推薦指數:
全基因組重測序基礎及高級分析知識匯總 oddxix 已關注 2018.09.20 17:04 字數 11355 閱讀 212評論 0喜歡 6 轉自:http://www.360doc.com/content/18/0208/11 ...
全基因組測序 全基因組測序分為從頭測序(de novo sequencing)和重測序(re-sequencing)。 從頭測序(de novo)不需要任何參考基因組信息即可對某個物種的基因組進行測序,利用生物信息學分析方法進行拼接、組裝,獲得該物種的基因組 ...
,可多種幾款流程比較。 實際上SV結果中會包含CNV,但往往會把CNV單獨拿出來分析。 ...
PacBio公司的業務范圍也就5個(官網): Whole Genome Sequencing Targeted Sequencing Complex Populations RNA Sequencing Epigenetics 其中全基因組測序應該是PacBio ...
宏基因組測序: 濃度>=50ng/ul OD260/280:1.8-2.0 DNA兩次需要量>=3ug 宏基因組測序需要提供什么樣品要求? (1)提供環境微生物的基因組DNA或者擴增產物,OD值在1.8 ...
WGS(Whole Genome Sequencing) 指將物種細胞里面完整的基因組序列全部DNA,檢測並排列,此技術幾乎能夠鑒定出基因組上任何類型的突變。 對於人類來說,全基因組測序的價值是極大的,它的信息包含了所有基因和生命特征之間的內在關聯性,當然也意味着更大的數據解讀 ...
全基因組鳥槍法測序是在獲得一定的遺傳及物理圖譜信息的基礎上,繞過bac克隆逐個排序的過程,將基因組DNA分解成2kb左右的小片段進行隨機測序,輔以一定數量的10kb的克隆和bac克隆的末端測序,利用超級計算機進行整合進行序列組裝的測序過程。 全基因組鳥槍法測序的主要步驟 ...
WGS(Whole Genome Sequencing) 指將物種細胞里面完整的基因組序列全部DNA,檢測並排列,此技術幾乎能夠鑒定出基因組上任何類型的突變。 對於人類來說,全基因組測序的價值是極大的,它的信息包含了所有基因和生命特征之間的內在關聯性,當然也意味着更大的數據解讀 ...