目錄 一、研究內容 1.比較基因組分析 2. 核心基因/非必需基因分析 泛基因組大小模擬 核心基因/非必需基因功能富集 核心基因/非必需基因保守性分析 核心基因/非必需基因與重復序列相關性 ...
套路 這通常就是基因組組裝后的必做分析,通過比較基因組學的手段進行分析,可以知道所研究物種在進化過程中哪些核心基因家族發生了變化,從而導致了其特殊的適應性機制的形成。 參考: Extremotolerant tardigrade genome and improved radiotolerance of human cultured cells by tardigrade unique prote ...
2017-01-17 13:07 0 4354 推薦指數:
目錄 一、研究內容 1.比較基因組分析 2. 核心基因/非必需基因分析 泛基因組大小模擬 核心基因/非必需基因功能富集 核心基因/非必需基因保守性分析 核心基因/非必需基因與重復序列相關性 ...
目錄 一、前沿概述 二、主要結果 重測序、組裝與注釋 泛基因組 SV特征 PAV與古多倍化,WGD事件 基因SV與基因融合 SV與大豆馴化 SV影響基因表達及其與性狀關聯 一、前沿概述 ...
宏基因組測序: 濃度>=50ng/ul OD260/280:1.8-2.0 DNA兩次需要量>=3ug 宏基因組測序需要提供什么樣品要求? (1)提供環境微生物的基因組DNA或者擴增產物,OD值在1.8 ...
出處:bilibili 關聯分析(Association):在交易數據、關系數據或其他信息載體中 ...
基因組注釋主要包括四個研究方向:重復序列的識別;非編碼RNA的預測;基因結構預測和基因功能注釋。我們將分別對這四個領域進行闡述。 1 重復序列的識別。 1.1 重復序列的研究背景和意義:重復序列可分為串聯重復序列(Tendam repeat)和散在重復序列 ...
參考基因組版本命名參考基因組聯盟(Genome Reference Consortium),它是由 NCBI,EBI,桑格研究所等機構組成。GRC 利用最佳的技術裝配,糾正,增加基因組序列,以此作為在生信分析領域作為參考的基因組。人基因組官名叫 GRCh38 (Genome ...
植物vs動物總結版: 簡述高等植物基因組(可以以擬南芥和水稻基因組為例)與高等動物基因組(可以以人類、果蠅等基因組為例)在基因結構層面展示出來的基本差異。 高等植物基因組與高等動物基因組在基因結構上的基本差異主要是生命組學的第一困境,即復制-轉錄負載困境。 機制: 1.從平衡流 ...
NextDenovo 是有武漢未來組團隊開發出來用於組裝ONT,Pacbio, HIFI (默認參數可對60-100X數據更有效),可通過correct--assemble對其進行組裝。組裝后, ...