總是跑數據，卻對數據一無所知，這說不過去吧。 看幾篇文章吧 Sequencing depth and coverage: key considerations in genomic analyses 只講二代 Assembly of large genomes using second generation sequencing 參考文獻 Identification of optimum seq ...
2016-12-08 10:57 0 11836 推薦指數：
摘要：如果不設置任何過濾標准的話，SOAPsnp會call出更多的SNVs；AtlasSNP2算法比較嚴格，因此call出來的SNVs數量是最少的，GATK 和 SAMtools call出來的數量位 ...
1.GATK DepthOfCoverage 結果生成四個文件 4096 Jan 13 21:39 ./ 4096 Jan 13 21:05 ../ 6417 Jan 13 21:39 test.sample_cumulative_coverage ...
全基因組測序 全基因組測序分為從頭測序(de novo sequencing)和重測序(re-sequencing)。 從頭測序(de novo)不需要任何參考基因組信息即可對某個物種的基因組進行測序，利用生物信息學分析方法進行拼接、組裝，獲得該物種的基因組 ...
單細胞測序技術(single cell sequencing) 2018-03-02 11:02 來源： 一呼百諾 點擊次數：6587關鍵詞： 前言 單細胞生物學最近幾年是非常熱門的研究方向。在這 ...
如何計算每個基因的覆蓋度與深度，有多種方法可以完成。如下演示使用samtools depth命令方法 1. 數據下載 1.1 Fastq文件下載 從NCBI下載Illumina Hiseq X Ten平台的RNA-Seq數據SRR7751429信息如上圖所示。 1.1.1 ...
SV -- Coverage 覆蓋率 本文內容來自： http://www.asic-world.com/systemverilog/coverage.html https://verificationguide.com/systemverilog ...
圖像深度是指存儲每個像素所用的位數,也用於量度圖像的色彩分辨率.圖像深度確定彩色圖像的每個像素可能有的顏色數,或者確定灰度圖像的每個像素可能有的灰度級數.它決定了彩色圖像中可出現的最多顏色數,或灰度圖像中的最大灰度等級.比如一幅單色圖像,若每個象素有8位,則最大灰度數目為2的8次方 ...
強化對深度的理解 在老版本的NGUI中，UI的顯示層次關系是依靠z軸進行的。在新版本的NGUI中，所有UI的z軸都被統一，然后用深度來決定和管理顯示的層次關系。關於深度，要記住一下關鍵點： 1.每一個UI Panel和每一個UI控件都一定會有一個Depth，深度值大代表顯示的優先級高 ...
