vegan 包是進行群落數據分析最常用的R包,其中的 specaccum 函數用來計算物種的累計曲線 首先看下官方示例: 出來的結果圖如下: 那么這幅圖表明了什么含義呢? 首先看下輸入數據 我們簡單的看一下BCI這個數據,它的每一行代表了一個樣本,不同樣 ...
這周的作業我開始得好遲啊。。。然而還是要努力做啊。。。 我是萌萌噠分割線 首先,百度進入官方頁面,看到這些: 也就是說,需要先安裝permute和lattice包。那么,如何安裝 呃 首先下載.tar.gz,然后在命令行 sudo R CMD INSTALL package.tar.gz 進入R環境,使用library 查看現在已經安裝的包 我是超級無敵可愛的分割線 下面的內容來自vegan tu ...
2016-11-04 19:49 0 4301 推薦指數:
vegan 包是進行群落數據分析最常用的R包,其中的 specaccum 函數用來計算物種的累計曲線 首先看下官方示例: 出來的結果圖如下: 那么這幅圖表明了什么含義呢? 首先看下輸入數據 我們簡單的看一下BCI這個數據,它的每一行代表了一個樣本,不同樣 ...
pheatmap包的安裝 1: 首先R語言的安裝路徑里面最好不要有中文路徑 2: 在安裝其他依存的scales和colorspace包時候要關閉防火牆 錯誤提示: 試開URL’https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin ...
自動安裝(在線安裝) 在R的控制台,輸入 install.packages("gridExtra") # 安裝 gridExtra install.packages("stepNorm", contriburl="http://www.your.url", dependencies ...
Adonis 分析 是基於距離矩陣的多變量方差置換分析, 代碼示例: 默認使用bray 距離來計算樣本間的距離矩陣 參考資料: https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics ...
Bioenv 分析通過 計算樣本群落結構的距離矩陣和 環境因子的距離矩陣,計算兩個距離之間的相關系數,挑選出最佳的環境因子組合; 默認情況下,計算 群落結構的距離矩陣時, 使用 ...
R實際是通過命令操作軟件,命令實際是在調用函數。 R包是R函數、數據、預編譯代碼以一種定義完善的格式組成的集合,包括R程序,運行該程序的其他語言(比如Java/C/Fortran),解釋這個程序功能、方法的幫助文檔,例子、測試數據等。 只有當一個包被載入時,它的內容才可以被訪問。一些常用 ...
安裝R語言中的外部包時,出現錯誤提示 試開URL’https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/windows/contrib/3.3/ggplot2_2.2.1.zip'Content type 'application/zip' length ...
載入包 載入數據 繪制熱圖 生成行列注釋 ...