作者:韓信子@ShowMeAI
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引言
之前ShowMeAI對強大的boosting模型工具XGBoost做了介紹(詳見ShowMeAI文章圖解機器學習 | XGBoost模型詳解)。本篇我們來學習一下GBDT模型(詳見ShowMeAI文章 圖解機器學習 | GBDT模型詳解)的另一個進化版本:LightGBM。
LightGBM是微軟開發的boosting集成模型,和XGBoost一樣是對GBDT的優化和高效實現,原理有一些相似之處,但它很多方面比XGBoost有着更為優秀的表現。官方給出的這個工具庫模型的優勢如下:
- 更快的訓練效率
- 低內存使用
- 更高的准確率
- 支持並行化學習
- 可處理大規模數據
- 支持直接使用category特征
下圖是一組實驗數據,在這份實驗中,LightGBM比XGBoost快將近10倍,內存占用率大約為XGBoost的1/6,准確率也略有提升。
1.LightGBM動機
互聯網領域的算法應用,通常背后都有海量的大數據。深度學習中一系列神經網絡算法,都是以mini-batch的方式喂數據迭代訓練的,總訓練數據量不受內存限制。
但我們用到的機器學習算法,比如GBDT(參考ShowMeAI文章 GBDT詳解)在每一次迭代的時候,都需要遍歷整個訓練數據多次。
- 如果把整個訓練數據一次性裝進內存,會明顯限制訓練數據的大小。
- 如果不裝進內存,反復地讀寫訓練數據又會消耗非常大的時間。
面對工業級海量的數據,普通的GBDT算法無法滿足需求。LightGBM提出的主要原因之一,就是為了解決上述大數據量級下的GBDT訓練問題,以便工業實踐中能支撐大數據量並保證效率。
2.XGBoost優缺點
我們之前介紹過強大的XGBoost(詳見ShowMeAI文章圖解機器學習 | XGBoost模型詳解),但XGBoost也依舊存在一些缺點,LightGBM針對其中的一部分進行了調整優化。XGB優缺點歸納如下:
1)精確貪心算法
輪迭代時,都需要遍歷整個訓練數據多次。如果把整個訓練數據裝進內存則會限制訓練數據的大小;如果不裝進內存,反復地讀寫訓練數據又會消耗非常大的時間。
- 優點:可以找到精確的划分條件。
- 缺點:計算量巨大、內存占用巨大、易產生過擬合。
2)Level-wise生長方式
XGBoost采用Level-wise的增長策略:基於層進行生長,直到達到停止條件。這種增長策略方便並行計算每一層的分裂節點,提高了訓練速度,但同時也因為節點增益過小增加了很多不必要的分裂,增加了計算量。
- 優點:可以使用多線程、可以加速精確貪心算法。
- 缺點:效率低下,可能產生不必要的葉結點。
3)對cache優化不友好
在預排序后,特征對梯度的訪問是一種隨機訪問,並且不同的特征訪問的順序不一樣,無法對cache進行優化。同時,在每一層長樹的時候,需要隨機訪問一個行索引到葉子索引的數組,並且不同特征訪問的順序也不一樣,也會造成較大的cache miss。
3.LightGBM優化點
上個部分其實也是LightGBM作者們,構建新算法時着重優化的點。概括來說,LightGBM主要有以下特點:
- 基於Histogram的決策樹算法
- 帶深度限制的Leaf-wise的葉子生長策略
- 直方圖做差加速
- 直接支持類別特征(Categorical Feature)
- Cache命中率優化
- 基於直方圖的稀疏特征優化
- 多線程優化
4.決策樹算法
1)XGBoost:Pre-sorted算法
XGBoost使用的是Pre-sorted算法,能夠更精確的找到數據分隔點。
- 首先,對所有特征按數值進行預排序。
- 其次,在每次的樣本分割時,用O(#data)的代價找到每個特征的最優分割點。
- 最后,找到最后的特征以及分割點,將數據分裂成左右兩個子節點。
這種pre-sorting算法能夠准確找到分裂點,但是在空間和時間上有很大的開銷。
- 由於需要對特征進行預排序並且需要保存排序后的索引值(為了后續快速的計算分裂點),因此內存需要訓練數據的兩倍。
- 在遍歷每一個分割點的時候,都需要進行分裂增益的計算,消耗的代價大。
2)LightGBM:直方圖算法
LightGBM使用的是直方圖算法(histogram algorithm),占用的內存更低,數據分割的復雜度更低。直方圖算法思想是:
- 將連續的浮點特征離散成k個離散值,並構造寬度為k的Histogram。
- 遍歷訓練數據,統計每個離散值在直方圖中的累計統計量。
- 在進行特征選擇時,只需要根據直方圖的離散值,遍歷尋找最優的分割點。
(1)內存優化
直方圖算法可以很大程度降低內存消耗,它不僅不需要額外存儲預排序的結果,還可以只保存特征離散化后的值(一般用8位整型存儲就足夠了)。
如圖所示,用8位整型存儲,內存消耗可以降低為原來的1/8。
(2)計算量優化
應用直方圖算法,計算代價也大幅降低,預排序算法每遍歷一個特征值就需要計算一次分裂的增益,而直方圖算法只需要計算k次(k可以認為是常數),時間復雜度從O(#data#feature)直接優化到 O(k#features)。
(3)注意點
直方圖算法的理解和注意點如下:
-
使用分桶bin替代原始數據相當於增加了正則化。
-
使用分桶bin意味着很多數據的細節特征丟失,相似的數據如果划分到相同的桶中,數據之間的差異就無法捕獲了。
-
分桶bin數量決定了正則化的程度,bin越少懲罰越嚴重,欠擬合風險越高。
-
因為預先設定了bin的范圍,構建直方圖時不需要對數據進行排序。
-
直方圖保存「划分閾值」、「當前bin內樣本數」、「當前bin內所有樣本的一階梯度和」。
-
閾值的選取是按照直方圖從小到大遍歷,使用了上面的一階梯度和,目的是得到划分之后△loss最大的特征及閾值。
(4)直方圖算法優缺點
-
Histogram算法並不是完美的。由於特征被離散化后,找到的並不是很精確的分割點,所以會對結果產生影響。但在實際的數據集上表明,離散化的分裂點對最終的精度影響並不大,甚至會好一些。原因在於decision tree本身就是一個弱學習器,采用Histogram算法會起到正則化的效果,有效地防止模型的過擬合。
-
時間上的開銷由原來的O(#data#features)降到O(k#features)。由於離散化,#bin遠小於#data,因此時間上有很大的提升。
Histogram算法還可以進一步加速。一個葉子節點的Histogram可以直接由父節點的Histogram和兄弟節點的Histogram做差得到。一般情況下,構造Histogram需要遍歷該葉子上的所有數據,通過該方法,只需要遍歷Histogram的k個捅。速度提升了一倍。
5.決策樹生長策略
1)樹生長策略調整
直方圖算法之上,LightGBM進行進一步的優化。它沒有使用大多數GBDT工具使用的按層生長(Level-wise)的決策樹生長策略,而使用了帶有深度限制的按葉子生長(Leaf-wise)算法。
2)XGBoost:Level-wise
XGBoost采用的是Level-wise(按層生長)策略生長的,能夠同時分裂同一層的葉子,從而進行多線程優化,不容易過擬合。
但不加區分的對待同一層的葉子,帶來了很多沒必要的開銷。因為實際上很多葉子的分裂增益較低,沒必要進行搜索和分裂。
3)LightGBM:Leaf-wise
LightGBM采用Leaf-wise(按葉子生長)生長策略,每次從當前所有葉子中找到分裂增益最大(一般也是數據量最大)的一個葉子,然后分裂,如此循環。
同Level-wise相比,在分裂次數相同的情況下,Leaf-wise可以降低更多的誤差,得到更好的精度。Leaf-wise的缺點是可能會長出比較深的決策樹,產生過擬合。因此LightGBM在Leaf-wise之上增加了一個最大深度的限制,在保證高效率的同時防止過擬合。
6.直方圖差加速
LightGBM另一個優化是Histogram(直方圖)做差加速。整個構建過程中可以觀察到:一個葉子的直方圖可以由它的父親節點的直方圖與它兄弟的直方圖做差得到。
一般來說構造直方圖,需要遍歷該葉子上的所有數據,但直方圖做差僅需遍歷直方圖的k個桶。利用上述特征,LightGBM可以在構造一個葉子的直方圖后,可以用非常微小的代價得到它兄弟葉子的直方圖,在速度上可以提升一倍。
7.類別型特征支持
大多數機器學習工具都無法直接支持類別型特征,我們會先將其編碼再做后續建模,如果使用one-hot這種編碼方式還會降低空間和時間效率。
LightGBM優化了對類別型特征的支持,可以直接輸入類別特征,不需要額外的編碼或one-hot 0/1展開。並在決策樹算法上增加了類別型特征的決策規則。
1)樹模型與one-hot編碼
one-hot編碼是處理類別特征的一個通用方法,然而在樹模型中,這可能並不一定是一個好的方法,尤其當類別特征中類別個數很多的情況下,主要的問題是:
問題1:可能無法在這個類別特征上進行切分。
使用one-hot編碼的話,意味着在每一個決策節點上只能使用one vs rest(例如是不是男性,是不是一線城市等)的切分方式。當類別值很多時,每個類別上的數據可能會比較少,這時候切分會產生不平衡,這意味着切分增益也會很小。
問題2:影響決策樹的學習。
就算可以在這個類別特征進行切分,也會把數據切分到很多零碎的小空間上,如下左圖所示。而決策樹學習時利用的是統計信息,在這些數據量小的空間上,統計信息不准確,學習會變差。但如果使用下右圖的分裂方式,數據會被切分到兩個比較大的空間,進一步的學習也會更好。
圈中的數值表示該結點內的數據。右圖中葉子節點 X=A || X=C 的含義是 X=A 或者 X=C 放到左孩子,其余放到右孩子。
2)LightGBM類別型特征處理方式
LightGBM采用了Many vs Many的切分方式解決one-hot編碼帶來的問題,實現了類別特征的最優切分。用LightGBM可以直接輸入類別特征,並產生上右圖的效果。
在1個k維的類別特征中尋找最優切分,朴素的枚舉算法的復雜度是 \(O(2^k)\),而LightGBM采用了如 On Grouping For Maximum Homogeneity的方法實現了 \(O(k\log k)\) 的算法。
算法流程如圖所示:
-
①在枚舉分割點之前,先把直方圖按每個類別的均值進行排序。
-
②接着按照均值的結果依次枚舉最優分割點。
從下圖可以看到,Sum(y)/Count(y)為類別的均值。當然,這個方法很容易過擬合,所以在LightGBM中加入了很多對這個方法的約束和正則化。
求解類別型特征的最優切分的具體流程如下:
① 離散特征建立直方圖的過程
統計該特征下每一種離散值出現的次數,並從高到低排序,並過濾掉出現次數較少的特征值。然后為每一個特征值,建立一個bin容器,對於在bin容器內出現次數較少的特征值直接過濾掉,不建立bin容器。
② 計算分裂閾值的過程
-
先看該特征下划分出的bin容器的個數,如果bin容器的數量小於4,直接使用one vs other方式,逐個掃描每一個bin容器,找出最佳分裂點。
-
對於bin容器較多的情況,先進行過濾,只讓子集合較大的bin容器參加划分閾值計算,對每一個符合條件的bin容器進行公式計算,得到一個值,根據該值對bin容器從小到大進行排序,然后分從左到右、從右到左進行搜索,得到最優分裂閾值。公式如下:
這里為什么不是label的均值呢?其實上例中只是為了便於理解,只針對了學習一棵樹且是回歸問題的情況。這時候一階導數是Y,二階導數是1),
- 沒有搜索所有的bin容器,而是設定了一個搜索bin容器數量的上限值,程序中設定是32,即參數max_num_cat。
- LightGBM中對離散特征實行的是many vs many 策略,這32個bin中最優划分的閾值的左邊或者右邊所有的bin容器就是一個many集合,而其他的bin容器就是另一個many集合。
③ 對於連續特征,划分閾值只有一個。對於離散值可能會有多個划分閾值,每一個划分閾值對應着一個bin容器編號。
當使用離散特征進行分裂時,只要數據樣本對應的bin容器編號在這些閾值對應的bin集合之中,這條數據就加入分裂后的左子樹,否則加入分裂后的右子樹。
8.並行支持與優化
LightGBM原生支持並行學習,目前支持「特征並行」和「數據並行」的兩種,LightGBM針對這兩種並行方法都做了優化。
-
特征並行:在不同機器在不同的特征集合上分別尋找最優的分割點,然后在機器間同步最優的分割點。
-
數據並行:讓不同的機器先在本地構造直方圖,然后進行全局的合並,最后在合並的直方圖上面尋找最優分割點。
1)特征並行
LightGBM在特征並行算法中,通過在本地保存全部數據避免對數據切分結果的通信。
2)數據並行
Lightgbm在數據並行中使用分散規約(Reduce scatter)把直方圖合並的任務分攤到不同的機器,降低通信和計算,並利用直方圖做差,進一步減少了一半的通信量。
基於投票的數據並行則進一步優化數據並行中的通信代價,使通信代價變成常數級別。在數據量很大的時候,使用投票並行可以得到非常好的加速效果。
更具體的內容可以看NIPS2016的文章: A Communication-Efficient Parallel Algorithm for Decision Tree。
9.網絡通信優化
XGBoost由於采用Pre-sorted算法,直接通信代價比較大;LightGBM采用的histogram算法通信代價小,通過使用集合通信算法,能夠實現並行計算的線性加速。
10.參考資料
- https://www.zhihu.com/question/51644470
- https://zhuanlan.zhihu.com/p/34698733
- https://lightgbm.readthedocs.io/en/latest/Features.html
- https://papers.nips.cc/paper/6907-lightgbm-a-highly-efficient-gradient-boosting-decision-tree.pdf
- https://huangzhanpeng.github.io/2018/01/04/A-Highly-Ef%EF%AC%81cient-Gradient-Boosting-Decision-Tree/
- https://www.msra.cn/zh-cn/news/features/lightgbm-20170105
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