1.基因染色體定位TBtools
Graphics-show gene on chr-第一個
文件准備:
①染色體長度信息
②基因位置信息

#①:染色體長度文件
用基因組序列提取每條染色體的長度信息,結果是NC_開頭的基因組編號,不是染色體號
記錄了每條染色體的長度信息。只要有基因組序列文件,可以使用 TBtools 的 Fasta Stat 直接生成一個。
Sequence Toolkit-Fasta Tools-Fasta Stats,勾選keep only
(1)基因組序列文件,Fasta格式

(2)輸出的染色體長度信息:ChrLen.tab.txt-兩列-第一列把NC改為LG系列 NC_:完整的基因組分子序列,標記的類別包括基因組、染色體、細胞器、質粒。

基因染色體定位圖的調節
chr Label Font:染色體標簽設置
Gene Label Font:基因標簽設置
chr Bar Color:染色體內部的顏色
chr Bar Border:染色體外邊框
1.基因染色體定位TBtools怎么讓染色體標簽在上面,而不是在在左邊。
用TBtools做基因染色體定位圖,怎么讓染色體標簽在上面,而不是在在左邊。
點擊:下面是方塊,上面是圓圈。
問題
1.染色體旋轉
2.基因字體顏色設置
3.加橫的標簽。
4.上邊界的距離怎么增加些。不用
答:
1.點染色體標簽,把圓圈放平。
2、3②group elements組元素
1.elements editor元素編輯器
①curr,element當前,元素
delete elenment:刪除元素,不選
fill collor:選null
Boarder Color邊框顏色:選擇黑色,selected
fill Alpha:不懂
Boarder Stroke
Rotate Angle旋轉角度
element type元素類型
gradient type漸變型
Z-Rank
②group elements組元素
③selected elements選定的元素
2.panel editor面板編輯器merge selected panels合並選定的面板
merge all panels
polar panel
