Molecular Dynamics 定義
簡單講分子動力學（Molecular Dynamics，MD）是在經典力學框架下，給定初始位置和速度，對分子體系時間演化（動力學）的模擬，本質上就是在計算機里進行一個well-controlled實驗。
DL_POLY 分子動力學模擬軟件
DL_POLY Classic 是由 W. Smith、TR Forester 和 IT Todorov 在 Daresbury 實驗室開發的通用分子動力學模擬包。它基於 DL_POLY_2 包，該包最初由EPSRC贊助下 Daresbury 實驗室的前計算化學小組為 EPSRC 的凝聚相計算機模擬協作計算項目 ( CCP5 ) 開發。
DL_POLY Classic 可以作為串行或並行應用程序執行。該代碼使用復制數據策略實現並行化，該策略適用於同構、分布式內存、並行計算機。該代碼可用於模擬多達 30,000 個原子，並在多達 100 個處理器上具有良好的並行性能，但在某些情況下它可能會超過或無法達到這些限制。
下載地址
https://gitlab.com/DL_POLY_Classic/dl_poly/-/archive/RELEASE-1-10/dl_poly-RELEASE-1-10.tar.gz
在軟件目錄下有一個build文件夾，里面有makefile．根據自己的計算機cpu類型將相應的makefile挎貝到source目錄中，並將文件名改為Makefile,然后就可以直接make dlpoly
• MakePAR - to build a parallel MPI version on a unix platform; 並行計算用這個Makefile
• MakeSEQ - to build a sequential (one processor) unix version;
• MakeWIN - to build a Windows (one processor, XP) version.