Anaconda安裝R及其環境配置

Anaconda安裝R語言及其環境配置

在正常使用中，發現集群中自帶R為3.5.1，很多packages裝不上（會出現non-zero exist報錯），並且沒有管理員權限，只能在子系統下安裝，因此考慮利用Anaconda3安裝新版本R語言，參考該博客：

首先安裝Anaconda

wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh
bash Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh

利用Anaconda安裝R語言及相關軟件包

conda create -n r_env r-essentials r-base r-environment
conda install -c bioconda bioconductor-biocinstaller
conda activate r-environment

裝完bioconductor感覺大多數的包都可以搞定了！
結束后發現打開R發現依舊是3.5.1

在用戶目錄下.bashrc文件中加入這么一句alias Rconda='conda activate r_env'並激活

source .bashrc
Rconda
R

成功：