Anaconda安装R及其环境配置

Anaconda安装R语言及其环境配置

在正常使用中，发现集群中自带R为3.5.1，很多packages装不上（会出现non-zero exist报错），并且没有管理员权限，只能在子系统下安装，因此考虑利用Anaconda3安装新版本R语言，参考该博客：

首先安装Anaconda

wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh
bash Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh

利用Anaconda安装R语言及相关软件包

conda create -n r_env r-essentials r-base r-environment
conda install -c bioconda bioconductor-biocinstaller
conda activate r-environment

装完bioconductor感觉大多数的包都可以搞定了！
结束后发现打开R发现依旧是3.5.1

在用户目录下.bashrc文件中加入这么一句alias Rconda='conda activate r_env'并激活

source .bashrc
Rconda
R

成功：