Anaconda安裝及R環境配置


一、Anaconda安裝

  本文是基於Ubuntu 16.04的Linux操作系統

  Anaconda系統的下載:wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh

  Anaconda系統安裝:sh Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh

  安裝過程中,會有協議的閱讀與同意,方可進行安裝。如果出現選項,請請選擇“yes”。此外,也可指定安裝路徑。

二、基於Anaconda的R版本的安裝

  2.1 在Anaconda安裝目錄(usrnamePath/anaconda3/bin/) bin目錄下,需找conda指令。基於該指令下載並安裝最新版本的R軟件和包

    usrPath/anaconda3/bin/conda create -n r_env r-essentials r-base

  2.2 激活Anaconda環境中的R語言環境。激活后,基於Anaconda環境的R被使用。此時,R為獨立於已有操作系統中的R版本,為個人用戶的R環境操作。

  usrPath/anaconda3/bin/conda activate r-environment

  如果要退出Anaconda環境中的R環境,可執行如下程序:

  usrPath/anaconda3/bin/conda deactivate

  2.3 可以將其配置到自己的環境變量中

  vi ~/.bashrc

  添加:

    alias Rconda='usrPath/anaconda3/bin/conda activate r-environment'

  source ~/.bashrc

  下一次打開即生效,即命令行輸入Rconda打開環境

三、常見錯誤

  如果上述問題出錯,可能是由於沒有將anaconda加入到配置文件中,具體操作如下:

  vi ~/.bashrc

  在文件末尾加上:

  export PATH="/usrPath/anaconda3/bin:$PATH"

  生效:

  source ~/.bashrc

  啟動環境:

  conda activate r-environment

 


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