統計學有兩大主要分支,分別是描述性統計學和推斷統計學。描述性統計學用於描述和概括數據的特征以及繪制各類統計圖表。總體數據,往往因為數據量太大而難以被獲取,所以就有了通過較小的樣本數據推測總體特性的推斷統計學。值得一提的是現今火熱的“大數據”一詞並不僅僅是指數據量大,在《大數據時代》一書中作者舍恩伯格強調“大數據”不是隨機樣本,而是所有數據,即總體,這與傳統的統計研究方法是有很大區別的。
推斷統計學的一個研究方向就是用樣本數據估算總體的未知參數,稱之為參數估計。如果是用一個數值進行估計,則稱為點估計;如果估計時給出的是一個很高可信度的區間范圍,則稱為區間估計。
本文先介紹了抽樣分布和中心極限定理,並用蒙特卡洛方法進行模擬;然后引入置信區間的概念,並將之用於分析BRFSS數據中的BMI指數上。
首先依舊是導入相關Python模塊和數據,其中brfss是專門用於讀取和清理美國行為風險因素監控BRFSS調研數據的模塊。
import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import seaborn as sns import brfss # 該模塊用於處理BRFSS數據 %config InlineBackend.figure_format = 'retina' df = brfss.ReadBrfss() # 讀取BRFSS數據
這里主要關注反應胖瘦程度的BMI指數,並將這一數據存入bmi變量中,其數據量有40萬之多。
bmi = df.bmi.dropna() # 取數據中的bmi列,並去除缺失值 len(bmi)
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中心極限定理
如果我們將上述40萬多份的BMI數據看成是總體,然后從中隨機抽取n個數據組成一份樣本,並計算該樣本的均值。重復這一過程1000次,我們就得到了1000個樣本的均值分布,即抽樣分布。
抽樣分布滿足中心極限定理,即在樣本量n越來越大時,均值的抽樣分布將越來越接近正態分布,該分布的均值等於總體的均值;標准差,在這里也稱為標准誤差SE滿足公式:

這里使用蒙特卡洛模擬的方法,在40萬BMI數據中隨機抽取n個數計算均值,並重復1000次,組成抽樣分布。以下的
sampling_distribution()
函數用於實現這一模擬過程,並繪制抽樣分布的直方圖和ECDF圖。
def sampling_distribution(data, sample_size=20, bins=40): '''抽樣分布模擬,輸出均值、標准差以及直方圖、ECDF圖''' # 隨機抽樣 sampling = [np.mean(np.random.choice(data, size=sample_size, replace=False)) for _ in range(1000)] # 輸出總體和抽樣分布的均值、標准差 mu = np.mean(data) se = np.std(data) / np.sqrt(sample_size) print('mean of sample means: %.2f' % np.mean(sampling)) print('population means: %.2f' % mu) print('Standard deviation of sample means: %.2f' % np.std(sampling)) print('Standard Error: %.2f' % se) # 繪制抽樣分布的直方圖、ECDF圖 fig = plt.figure(figsize=(16,5)) p1 = fig.add_subplot(121) plt.hist(sampling, bins=bins, rwidth=0.9) plt.xlabel('sampling means') plt.ylabel('counts') p2 = fig.add_subplot(122) plot_ecdf(sampling, xlabel='sampling means', label='sampling ') sample = np.random.normal(mu, se, size=10000) plot_ecdf(sample, xlabel='sampling means', label='normal distribution') plt.show() def ecdf(data): '''計算ECDF''' x = np.sort(data) y = np.arange(1, len(x)+1) / len(x) return (x,y) def plot_ecdf(data, xlabel=None , ylabel='ECDF', label=None): '''繪制ECDF圖''' x, y = ecdf(data) _ = plt.plot(x, y, marker='.', markersize=3, linestyle='none', label=label) _ = plt.legend(markerscale=4) _ = plt.xlabel(xlabel) _ = plt.ylabel(ylabel) plt.margins(0.02)
下面我們將樣本量n分別取為10、20、100,進行三次模擬。
sampling_distribution(bmi, sample_size=10)
mean of sample means: 27.95 population means: 28.04 Standard deviation of sample means: 2.04 Standard Error: 2.10

sampling_distribution(bmi, sample_size=20)
mean of sample means: 28.11 population means: 28.04 Standard deviation of sample means: 1.50 Standard Error: 1.49

sampling_distribution(bmi, sample_size=100)
mean of sample means: 28.05 population means: 28.04 Standard deviation of sample means: 0.69 Standard Error: 0.67

觀察上面的輸出結果和圖形,我們發現隨着樣本量的遞增,抽樣分布越來越靠近正態分布,其均值和標准差也越來越符合中心極限定理中給出的關系。
一般當n大於等於30時,樣本均值的抽樣分布近似為正態分布。此時我們可以用樣本的均值來估計總體的均值,這就是點估計的一種最簡單的方式。但從上述分布也可以看出,樣本均值其實是以一定概率在總體均值附近浮動的,所以這就有了后面將要講的置信區間。
關於中心極限定理,還有一點需要強調的是,無論變量原來的分布是什么樣的,其均值的抽樣分布在n足夠大時都會接近正態分布。比如我們研究BRFSS數據中人們每周運動的總時間(單位:分鍾),大部分人每周運動的時間少於500分鍾,而極少數人能達到3000分鍾,其直方圖反應數據大部分集中在左側,而右側有一條長長的尾巴。
exemin = df[df.exemin != 0].exemin.dropna() # 提取鍛煉時間數據,丟棄0或者缺失值 plt.hist(exemin,bins=40, range=(0,3000), rwidth=0.9) # 繪制直方圖 plt.xlabel('exercise mins per week') plt.ylabel('counts') plt.show()

顯然這一數據分布並不滿足正態分布,但是我們采用上述相同的方法模擬其樣本均值的抽樣分布,在樣本量n為1000時,抽樣分布與正態分布符合的非常好。可見中心極限定理並不要求變量原來分布的樣子,這也正是其魅力所在。
sampling_distribution(exemin, sample_size=1000)
mean of sample means: 499.54 population means: 499.37 Standard deviation of sample means: 23.60 Standard Error: 23.75

正態分布的特性
既然中心極限定理中涉及了正態分布,我們就來看看其均值和標准差的一些性質。這里導入scipy的統計模塊,使用scipy.stats.norm()
模擬標准正態分布,即均值為0,標准差為1。使用norm.pdf()
計算概率密度,並繪制概率密度函數(PDF)圖。
import scipy.stats norm = scipy.stats.norm() # 標准正態分布 x = np.arange(-5, 5, 0.02) y = norm.pdf(x) # 概率密度 plt.plot(x,y) plt.axvline(x=0,ymax=0.95, linestyle='--', color='red', alpha=0.5) plt.axvline(x=1,ymax=0.59, linestyle='--', color='green') plt.axvline(x=-1,ymax=0.59, linestyle='--', color='green') plt.axvline(x=2,ymax=0.16, linestyle='--', color='blue') plt.axvline(x=-2,ymax=0.16, linestyle='--', color='blue') plt.margins(0.02) plt.show()

PDF圖中曲線下的面積代表了概率, 使用norm.cdf()
可計算這部分面積,即累積概率分布。於是我們就可以得到變量距離均值在1個標准差范圍內的概率為0.68,2個標准差范圍內的概率是0.95,3個標准差范圍內的概率是0.997。可見在正態分布中,數據主要集中在3個標准差之內。
print('1 sigma : %.3f' % (norm.cdf(1) - norm.cdf(-1))) print('2 sigma : %.3f' % (norm.cdf(2) - norm.cdf(-2))) print('3 sigma : %.3f' % (norm.cdf(3) - norm.cdf(-3)))
1 sigma : 0.683 2 sigma : 0.954 3 sigma : 0.997
反過來,我們也可以通過概率來求變量分布的區間,這里使用norm.interval()
,比如95%的情況下變量分布在-1.96到1.96之間,99%的情況下分布在-2.58到2.58之間。
norm.interval(0.95)
(-1.959963984540054, 1.959963984540054)
norm.interval(0.99)
(-2.5758293035489004, 2.5758293035489004)
置信區間
在能夠計算正態分布中一定概率下對應的變量區間后,我們再回到之前用樣本均值估計總體均值時遺留的問題,即樣本的均值圍繞總體均值在一定范圍內浮動的。我們需要估算總體均值在多大的概率下落在抽樣的隨機區間內,這就是置信區間。
我們仍然將40多萬的bmi數據當成是總體,然后從中隨機抽取樣本量為100的數據,根據中心極限定理繪制抽樣分布圖如下。
sample_size = 100 # 計算總體的均值和標准差 mu = np.mean(bmi) se = np.std(bmi) / np.sqrt(sample_size) # 繪制正態分布的PDF norm = scipy.stats.norm(mu, se) x = np.arange(26, 31, 0.01) y = norm.pdf(x) plt.plot(x,y) # 繪制抽樣分布的直方圖 sample_size = 100 sampling = [np.mean(np.random.choice(bmi, size=sample_size, replace=False)) for _ in range(1000)] plt.hist(sampling, bins=40, rwidth=0.9, normed=True, alpha=0.7) plt.show()

根據正態分布的性質,在95%的概率下,均值分布區間是(26.74, 29.35)。也就是說,在樣本量為100時,我們有95%的信心相信總體均值落在26.74和29.35之間,這就是95%的置信區間。同理,99%的置信區間是(26.33, 29.76)。注意這是在大樣本量的情況下,我們才能使用正態分布,而如果樣本量n小於30,則需要采用t分布,此處就不展開了。
norm.interval(0.95)
(26.738141245959351, 29.346706751112283)
norm.interval(0.99)
(26.328305902131977, 29.756542094939658)
區間估計的應用
回到本系列文章一直在探索的一個問題,即比較富人和普通人的BMI指數。此時,bmi數據不再當做總體看待,而是作為調查的樣本,總體是BRFSS數據針對的全體美國人。首先將bmi數據按照收入等級分為兩組,即富人bmi數據和普通人bmi數據。
df2 = df[['bmi', 'income']].dropna() # 提取數據中bmi和收入水平income這兩列,並忽略缺失值 bmi_rich = df2[df2.income == 8].bmi # 收入水平為8級的,認為是富人 bmi_ord = df2[df2.income != 8].bmi # 收入水平為1-7級的,認為是普通人群
以下定義了mean_ci()
函數,根據置信區間的計算公式,計算95%置信度下均值所在的區間。
def mean_ci(data): '''給定樣本數據,計算均值95%的置信區間''' sample_size = len(data) std = np.std(data, ddof=1) # 估算總體的標准差 se = std / np.sqrt(sample_size) # 計算標准誤差 point_estimate = np.mean(data) z_score = scipy.stats.norm.isf(0.025) # 置信度95% confidence_interval = (point_estimate - z_score * se, point_estimate + z_score * se) return confidence_interval
於是得到富人bmi95%的置信區間為(27.42, 27.49), 普通人bmi95%的置信區間為(28.51, 28.57)。這兩個區間間隔的還比較遠,數值上差不多有1這么多。所以我們可以比較有信心的得出富人更瘦的結論。
mean_ci(bmi_rich)
(27.415906122294761, 27.485560606043915)
mean_ci(bmi_ord)
(28.509003170593907, 28.565637279855423)
但要注意了,以上之所以能得到這么肯定的結論,源於使用的樣本數據量非常大,這大大縮小了置信區間的范圍(這可以從中心極限定理中標准誤差的公式看出)。現在讓我們使用前500個數據,看看在樣本較少時會發生什么情況。
mean_ci(bmi_rich[:500])
(27.849838839563304, 28.791561160436636)
mean_ci(bmi_ord[:500])
(28.200546441671069, 29.303493558328935)
此時富人bmi95%的置信區間為(27.85, 28.79),而普通人bmi95%的置信區間為(28.20, 29.30),很明顯這兩個區間都變大了。盡管富人的bmi指數仍有相對較小的趨勢,但是這兩個區間有部分重合,這時我們就無法得出非常肯定的結論了。可見樣本量在做判斷時起着非常重要的作用,樣本越大,判斷越准確,這也是與我們常識相符的。
小結
在這一篇中,我們了解了抽樣分布的概念,中心極限定理的含義,正態分布的概率分布,最重要的是使用置信區間的計算方法,通過樣本數據估算總體的均值范圍,至此我們進入了推斷統計學的領域。
針對富人是否更瘦這個問題上,雖然使用了置信區間得出了較肯定的結論,但是仍然沒有對富人更瘦這個假設做出明確的判斷。在下一篇中我們將會講到推斷統計學的另一個領域:假設檢驗,即對參數的假設值進行決策,屆時我們將和上述問題來個了斷。
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