Flye: 原始 PB / ONT reads 作為輸入文件，輸出 polished contigs文件
| Genome | Data | Asm.Size | NG50 | CPU time | RAM |
|---|
| Human CHM1 | PB 100x | 2.8 Gb | 18.8 Mb | 2700 h | 676 Gb |
CHM1 was run with --asm-overage 40
Flye使用重復圖作為核心數據結構。與de Bruijn圖（需要精確的k-mer匹配）不同，重復圖的邊表示基因組序列，節點定義了連接點。每個邊分為獨特的或重復的。基因組以未知方式遍歷圖，因此每個唯一的邊在遍歷中恰好出現一次。重復圖揭示了基因組的重復結構，這有助於重建最佳裝配。
參考來源：
https://github.com/fenderglass/Flye