Pacbio下機數據格式說明

RS II  Sequel

在下機文件中，主要有三類文件，bam 文件，bam.pbi 文件，以及xml文件。
當我們習慣性的去尋找熟悉的fastq格式文件做分析時，發現找不到了，因為在sequel平台中bam 文件成為了它的替代者，因為其更節約儲存空間。這是文件格式的一個重大更新。
用於后續分析的文件一般是.subreads.bam，這等同於RS II 中的.subreads.fastq

 

參考資料：

https://www.cnblogs.com/renping/p/9061130.html