生命組學
按照功能分類遺傳物質，可能的分類有系統流、操作流、平衡流等等。下面是使用該理論解釋DNA與RNA的關系：
DNA和RNA有很大不同，DNA存儲遺傳信息，作為生命活動的最內核物質，如同操作系統內核一樣，因而被稱為系統流。依據中心法則得到的翻譯得到RNA，RNA再翻譯成蛋白質，蛋白質用於生命活動，所以RNA是隨着生命活動不斷轉移和改變的，故被稱為操作流。為了滿足不同生命活動的需要，RNA變得比DNA靈活許多。但是DNA作為遺傳物質的內核，必須保證一定的穩定性，否則生物形態就不可能在一段時間內保持穩定。
RNA的靈活性體現在它的鹼基互補配對范圍的擴大，鏈上存在大量的修飾，同一個體細胞內RNA序列的不同，易突變（時間異質性和空間異質性），數據量（不同分類*不同修飾（修飾核苷酸的重要性：高比例，參與結構，細胞中動態變化）*其他機制...）一旦上升，其組合數目也在上升，因而類型繁多，最終導致功能強大。
Eg:rRNA具有平衡流（極端條件下的活動）和操作流（日常活動）兩方面功能，這說明生化反應離不開rRNA。
為了研究單分子內的活動（特別是RNA的活動），現在存在以下檢測化學修飾的技術：
A.質譜：分辨率和敏感度低；
B.抗體捕獲＋RNA-seq；
C.化學變構＋RNA-seq；
d逆轉錄＋RNA-seq
它們存在的共同缺點：需大量樣本，間接測序，無法實現單細胞、單分子的定位、定時、定量。盡管存在以上問題，若我們用DNA測序技術的話，效果更不好。因為DNA測序技術是將RNA打碎，然后反轉錄為cDNA，因為RNA上的修飾位點無法找到互補鹼基，所以利用此方法找到的cDNA是不准確的。
如今，可以測得的轉錄組數據有以下格局：
現有設備無法測得修飾，使用現存技術錯誤率高，所以急需能測修飾的設備。現有的技術有：
四代單分子RNA測序的核心技術：
1.ZMW：在模板鏈將帶熒光的游離核苷酸分子固定下來的過程中，基於AI的圖像識別技術，找到該熒光分子通過質譜確定其base
2.采用人造納米孔模仿噬菌體的蛋白泵(該蛋白泵會將核苷酸分子泵出來)，通過檢測測電流變化以此確定base
reference：yujun An Introduction to Holovivology (Lifeomics)