韋恩圖 Venn Diagram
Venn Diagram，也稱韋恩圖、維恩圖、文氏圖，用於顯示元素集合重疊區域的圖示。
韋圖繪制工具
常用R語言的VennDiagram包繪制，輸出PDF格式方便修改。此外還有非常多的在線工具，使用方便。
詳見“輕松繪制各種Venn圖”
韋恩圖在擴增子中用途
展示各樣品和組間共有、各組特有的OTU；由於此類結果缺少統計支持，假陽性率高，近年來使用越來越少。
展示各組間差異OTU共有或特有情況；較常用。
展示差異OTU所屬的Taxonomy歸類后的共有或特有情況；當在OTU水平重疊結果不好，可按分類學級別逐級向上找規律。
看圖實戰(Result)
示例1. 差異OTU共有或特有
這篇文章分析了水稻根不同區域的細菌組成，16S分析文章較系統的作品，兩年被引用147次，推薦閱讀
圖2.B/C 韋恩圖展示根不同區域富集或下降的OTU的共有和特有情況
1. 圖中元素解釋
- 圖頂部Enriched或Depleted標簽代表OTU的類型，分別代表OTU是顯著富集/上調，還是顯著消減/下調；
- 兩圖中間圖注顏色，紫、綠和藍分別代表根際、根表和根內；
- 圖中非重疊部分為每個組特有，圖中重疊部分為重疊各組共有，並將數字標示在該范圍內；如B中僅藍綠重疊區的175代表僅在這兩者在共有的OTU數量；而中間的96代表在三組中均共有的OTU。
2. 圖表結果：圖中顯示根際、根表和根內，無論富集還是消減類型中大部分為共有的OTU；這一結果表明，根系微生物組的形成過程，可能是由根際、根表和根內逐步建立起來。
3. 經驗和技巧：合適的顏色和透明度選擇很重要；可以將各種標簽也添加對應顏色更容易區分各組；多韋恩圖並排，有利於進一步的比較和規律發現
示例2. 韋恩圖比較共有細菌科
這篇文章是Dangl組2015年Science，是最早植物人工重組菌群的文章，研究了植物水楊酸對微生物組的影響，開山之作值得閱讀
- 圖1. 植物防御激素突變體改變根細菌群體。 D. 上圖展示三種水楊酸(SA)下調突變體sid2, pad4和雙突DEPS三種材料中差異科水平共有和特有情況。左圖為共同富集的科、右圖和共同下調的科；
- 圖表結果：表明三種突變體在科水平上對細菌群體的調控規律的一致性較好，也進一步證明這些差異科的真實性；
- 作圖經驗：分類學上分為界、門、綱、目、科、屬、種，還有人為定義的OTU，到底在那一層面進行Venn圖比較。選擇的原則是先用OTU，如果沒有發現很好重疊，很可能是在更高級別分類水平的功能重疊，從底層屬向上嘗試。本研究是找到科水平有較好一致結果