千人基因組計划數據庫下載某段區域SNP


下載vcf文件:

方法一:進入ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/release/20130502/,直接下載相應染色體的vcf

方法二:進入http://grch37.ensembl.org/Homo_sapiens/Tools/DataSlicer

 

假定要尋找“6:133098746-133108745”這段距離的SNP數據,“6”表示6號染色體,后面的數據表示距離。

按下圖所示操作:

 

點擊“run”,進入如下界面后,再點擊“view results”

 

彈出如下界面,再點擊“Download results file”。即可得到我們要的結果

 下載map文件和ped文件:

進入鏈接

 

點擊后,彈出如下界面:

接着下載info文件和map文件:

 


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