使用R繪制Venn Diagram

R中有很多繪制venn diagram的函數，包括limma中的vennDiagram，gplot中的venn，不過這兩種函數的缺點是

1. 非彩色

2. 不能夠按照比例繪制

venneuler函數繪制出來的圖不夠精細，而且只是顯示出集合的名稱，沒有寫明各子集、交集都是多少數量。

搜索半天，終於發現R中有一種不錯的文氏圖繪制函數：

VennDiagram！

首先install.packages('VennDiagram')安裝即可

然后

setwd('') #你需要的目錄　

             
          library('VennDiagram') 
          
 
          VD = venn.diagram(width=4000,margin = .07, 
          
 
          x = list(HM450K_All_Probes = Probes_HM450k_All, 
          
 
          DMR_Probes_EDRN_HM27k = Probes_Suh_DMR, 
          
 
          Top20k_Varied_Probes_TCGA = Probes_TopVar_HM450K, 
          
 
          DMR_Probes_TCGA = Probes_TCGA_DMR_450K 
          
 
          ), 
          
 
          col = 'black', 
          
 
          filename = 'VennDiagram_for_DMR_probes.tiff', 
          
 
          fill = c('green','yellow', 'blue','red')) 
         

注意事項：

1. 最好作圖前設置好目錄，圖片不會在R中出現，而是直接儲存在目錄中；因此，file那么一定要填寫

2. venn.diagram數據所需格式為list