使用R绘制Venn Diagram

R中有很多绘制venn diagram的函数，包括limma中的vennDiagram，gplot中的venn，不过这两种函数的缺点是

1. 非彩色

2. 不能够按照比例绘制

venneuler函数绘制出来的图不够精细，而且只是显示出集合的名称，没有写明各子集、交集都是多少数量。

搜索半天，终于发现R中有一种不错的文氏图绘制函数：

VennDiagram！

首先install.packages('VennDiagram')安装即可

然后

setwd('') #你需要的目录　

     
  library('VennDiagram') 
  
 
  VD = venn.diagram(width=4000,margin = .07, 
  
 
  x = list(HM450K_All_Probes = Probes_HM450k_All, 
  
 
  DMR_Probes_EDRN_HM27k = Probes_Suh_DMR, 
  
 
  Top20k_Varied_Probes_TCGA = Probes_TopVar_HM450K, 
  
 
  DMR_Probes_TCGA = Probes_TCGA_DMR_450K 
  
 
  ), 
  
 
  col = 'black', 
  
 
  filename = 'VennDiagram_for_DMR_probes.tiff', 
  
 
  fill = c('green','yellow', 'blue','red')) 
 

注意事项：

1. 最好作图前设置好目录，图片不会在R中出现，而是直接储存在目录中；因此，file那么一定要填写

2. venn.diagram数据所需格式为list