R是開源的統計計算和作圖語言，與S語言很相似。R的語法與其他語言很相似，功能很強大，可以到這里看看截圖。主頁是 http://www.r-project.org/
可以點擊這里下載R，這里有很權威的英文教程。本站提供幾本中文教程(pdf)的打包下載，更多的隨便搜索一下就可以找到。
BioConductor是建立在R語言環境上的生物芯片數據和基因組數據分析軟件包，主頁是 http://www.bioconductor.org/
BioConductor由許多package組成，可以全部安裝，也可以單獨安裝。BioConductor的安裝是在R控制台，輸入：
source(“http://bioconductor.org/biocLite.R”)
biocLite()
更多安裝設置請看這里
BioConductor的使用文檔可以在這里找到，而這里給出了其中package的簡單使用方法。