Matlab是矩陣運算/線性代數最常用的庫。不過由於licence問題，一般更多用於做實驗什么的，另外，雖然Matlab可以方便的用C寫擴展，但是Matlab自己的函數卻很難被其他語言調用。
Octave是Matlab一個不錯的開源替代，不過Octave也有一些問題，1，Octave並沒有實現Matlab太多功能 2， Octave在做一些沒有向量化的矩陣計算時，非常非常慢（大致比Matlab慢200倍左右）
C科學計算最經典的庫是LAPACK/MKL/AKL 之類，不過用起來非常麻煩，有很多為這些庫的封裝，保留速度的同時，提升接口的友好性。這里（http://verdandi.gforge.inria.fr/doc/linear_algebra_libraries.pdf）是一些庫的比較。
Armadillo是其中一個比較高效同時也比較友好的C++科學計算庫（http://arma.sourceforge.net/）
這里(http://arma.sourceforge.net/armadillo_nicta_2010.pdf)有一些Armadillo和其他庫（包括Matlab，Octave)的比較, 看起來是很厲害的一個庫，從給的example來看，接口還是比較友好的，應該會是一個比較流行的庫。