官網地址：
http://unity3d.com/support/documentation/Manual/ExternalVersionControlSystemSupport.html
官方有提供，但是要花錢。可以用SVN。
轉一個別人的翻譯：
算是從unity3d官方網站上的翻譯，如果你沒有看到，可以看下，這個也是我自己碰到比較麻煩的事情，經常windows下提交，然后mac下更新下去一堆關聯沒了，有些可以reimport可以變好，有些要重新關聯，麻煩的很，因為我們漏了一些東西沒有提交到版本控制中。
- 在unity3d中建立一個項目，如：InitialUnityProject，你可以加入一些assets的package或者放到以后加也沒關系，我一般是剛開始是空的項目，空的場景，然后保存，一些asset可以在用到的時候選擇性的添加，不然一堆東西看着也是麻煩的
- Edit->Project Settings->Editor，選擇Enable, 我在4.3.1的時候，安裝了默認是disable的，這里要開起來，這樣你的asset每個就會有meta 文件生成，大家可以用ultraedit等打開看下里面的東西，注意這個文件最好生成后不要自己去修改和刪除，提交到svn即可，這個文件是文本，svn可以merge的
- 退出unity3d,當然你可以保存你的空場景
- 刪除Library下的所有文件和目錄，不過以下的文件要保留，其實也就是一些配置的東西：
- EditorBuildSettings.asset
- InputManager.asset
- ProjectSettings.asset
- QualitySettings.asset
- TagManager.asset
- TimeManager.asset
- AudioManager.asset
- DynamicsManager.asset
- NetworkManager.asset
- 不過在mac下面比較搞笑的是，它不會自動生成cache目錄，他會生成其他的如preview之類的，但cache不會，你如果reimport，則他會報錯，說不能從temp復制到cache.搞不清楚他自己為啥不創建，懷疑寫程序的人有點想當然了，沒判斷目錄是否存在吧。所以在mac下，自己要創建下cache目錄，不然你報錯可能不知道怎么回事情。
- 把項目文件夾Import到svn服務器上，命令行如下：
svn import -m"Initial project import" InitialUnityProject svn://my.svn.server.com/MyUnityProject - 你可以從svn 服務器上check out出來整個項目，任何組內的開發人員都可以
svn co svn://my.svn.server.com/MyUnityProject
看看所有用到的Assets下面的文件是否都已經在版本控制下了 - 建議： 可以為Library設立ignore ,如果用命令行的話
svn propedit svn:ignore MyUnityProject/Library
svn 會打開一個文本編輯器，添加所有除了下面文件外的目錄和文件到這個文本中- EditorBuildSettings.asset
- InputManager.asset
- ProjectSettings.asset
- QualitySettings.asset
- TagManager.asset
- TimeManager.asset
- AudioManager.asset
- DynamicsManager.asset
- NetworkManager.asset
- 當用unity3d打開項目的時候，一些丟失的文件會全部重新建立，如Library中被我們刪除了的，如果還是不行，可以用reimport all
- 最后就可以用svn commit了
svn ci -m"Finishing project import" MyUnityProject
一些注意點：
(1) Unity3D的二進制資源必須加鎖進行版本控制，因為它沒辦法merge；
(2) Unity3D自己產生的C#工程相關文件，包括VS產生或者Mono產生的，都不需要歸入版本控制；
(3) 在新加入項時，Unity3D會產生一個同名的.meta文件，這個文件記錄了此項一個唯一的64位的guid，這個文件必須上傳，否則會出現各種缺失的異常情況（比如腳本Miss等）
(4) 對於Library文件夾，有以下幾個.Asset文件需要進行版本管理：
TimeManager
TagManager
QualitySettings
ProjectSettings
NetworkManager
InputManager
EditorBuildSettings
DynamicsManager
AudioManager
即便如此，在使用Editor進行開發時，由於需要經常改動場景的.unity 文件，而這個是二進制的，所以需要得鎖且不能Merge。感覺並行開發的難度還是比較大的，Unity3D還是比較適合個人開發者和較小團隊開發，對於大型團隊開發，無論是從版本管理還是代碼結構上，都覺得不太方便和自然。