Augustus 进行基因注释
目前的从头预测软件大多是基于HMM(隐马尔科夫链)和贝叶斯理论，通过已有物种的注释信息对软件进行训练，从训练结果中去推断一段基因序列中可能的结构，在这方面做的最好的工具是AUGUSTUS它可以仅使用序列信息进行预测，也可以整合EST, cDNA, RNA-seq数据作为先验模型进行预测 ...
原文：基因注释
注释过程：这一步一般都需要手动去鉴定和校正，当然也可以利用一些软件来校正，运用这类过程的软件JIGSAW EVidenceModeler EVM 和 GLEAN 以及后续软件Evigan 。 通过估计每一个来源的基因证据误差的类型和频率, 进而选择误差最小的结果 maker 在基因组注释上，MAKER算是一个很强大的分析流程。能够识别重复序列，将EST和蛋白序列比对到基因组，进行从头预测，并在最 ...
2020-04-07 11:25 0 991 推荐指数：
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