原文:WGCNA-cytoscape-analysis

全套R代码复刻: WGCNA installsource https: bioconductor.org biocLite.R biocLite c AnnotationDbi , impute , GO.db , preprocessCore install.packages c matrixStats , Hmisc , splines , foreach , doParallel , fas ...

2019-03-11 17:39 0 1499 推荐指数:

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详解WGCNA

建议查资料来源: 1、 微信搜索,很多公众号写的比较全 2、 CSDN代码解读比较好,相关小点也说的比较好。报错代码一部分也能查到。 3、 博客园 4、 简书 5、 谷歌 一、了解到底什么是WGCNA。 先通读了解相关概念。先不要去纠结代码。看最基础的概念就好,实在 ...

Tue Sep 03 05:26:00 CST 2019 0 1064
WGCNA算法研究笔记

Network Analysis中文名有翻译成加权关联网络分析的,感觉不是很恰当,英文来得比较直接。本来是佟昊从老 ...

Sat Apr 04 06:52:00 CST 2015 0 5288
安装cytoscape时的折腾

问题: 安装cytoscape时,提示: error信息: No suitable Java Virtual Machine could be found on your system.The version of the JVM must be at least 1.8.0_152 ...

Fri Nov 22 20:07:00 CST 2019 0 2291
STRING Cytoscape 网络互作图

网络图(Network)看似复杂,其实构成非常简单,网络图是一种图解模型,形状如同网络,故称网络图,由节点(node)和连线(edge)两个因素组成的。其中 node 又分为 source node( ...

Tue Aug 27 19:06:00 CST 2019 1 5927
Cytoscape软件简介

•  Cytoscape一款开源的网络显示和分析软件。    软件的核心部分提供了 网络显示、布局、查询等方面的基本功能。 •  Cytoscape源自系统生物学,通过Cytoscape,用户可以在可视化的 环境下将这些生物网络跟基因表达、    基因型等各种分子状态信息整合 在一起,还能 ...

Mon Jul 29 03:44:00 CST 2019 0 647
cytoscape.js 教程

因为数据要展示双向关系,最终选用了cytoscape.js。 效果如图,echarts只能显示单项数据关系。 据我理解,这个插件分两种,一种是基于jquery的,另一种是原声的。 基于jquery是加在jquery对象上的。因为基于jquery的无法在线上显示关系。最终选择 ...

Wed Jun 12 22:08:00 CST 2019 1 3679
Cytoscape.js

let cy = cytoscape({ // initial viewport state: zoom: 1, // 图表的初始缩放级别.可以设置options.minZoom和options.maxZoom设置缩放级别的限制. pan: {x: 0, y ...

Wed Dec 02 17:46:00 CST 2020 0 391
Cytoscape基础教程笔记

昨天开始学用Cytoscape,其tutorial分为两个部分,基础的和高级 的。基础教程又分成了四课:Getting Started、Filters & Editor、Fetching External Data和Expression Analysis。为防忘记,做个摘记。 第一课 ...

Fri Jul 19 01:37:00 CST 2019 0 1450
 
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