GWAS入门必看教程:Statistical analysis of genome-wide association (GWAS) data 名词解释和基本问题: 关联分析:就是AS的中文,全称是GWAS。应用基因组中数以百万计的单核苷酸多态;SNP为分子遗传标记,进行全基因组水平 ...
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到底什么是eQTL? eQTL和QTL之间有什么联系?为什么说QTL比eQTL难很多? QTL和GWAS有什么关系? GTEx数据库里的eQTL数据如何利用? 说eQTL之前必须先解释Q ...
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https://asia.ensembl.org/info/docs/tools/vep/index.html https://github.com/Ensembl/ensembl-vep ...
问题: Trios分析的基本原理和假设 Trios分析应用的场景? Trios与其他方法相比的优缺点 Trios研究的经典案例 Trios分析的基本原理和假设 从医院的病例开始,我们收集了一些特病表型的病人,不知道致病原因pathogenesis,有可能是遗传 ...
有很多概念需要明确区分: 人有23对染色体,其中22对常染色体autosome,另外一对为性染色体sex chromosome,XX为女,XY为男。 染色体区带命名:在标示一特定的带时需要包括4项 ...
这个时代的生信,统计遗传,不懂或不会用这个数据库就说不过去了。 看看10年GWAS里是如何定位和评价UK biobank的: For the near future, the UK Biobank is pushing the barriers further by releasing ...
这是一个进化学上的概念,基因组的序列是不断进化而来的,根据45个脊椎动物的基因组序列,通过多重比对,我们就可以知道人类基因组上每个位置的保守性,一些高度保守的区域可以做非常有意思的下游分析。 Thi ...
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搞GWAS和WGS必须要懂Association Test,就像搞genomics必须要懂比对alignment一样。 先从常识理解,Association关联,是一个比correlation ...