功能内聚：完成一个单一功能，各个部分协同工作，缺一不可。 顺序内聚：处理元素相关，而且必须顺序执行。 通信内聚：所有处理元素集中在一个数据结构的区域上。 过程内聚：处理元素相关，而且必须按特定的次序执行。 瞬时内聚：所包含的任务必须在同一时间间隔内执行（如初始化模块）。 逻辑 ...

shannon菌群多样性指数 H=－∑（Pi）（㏑Pi） Pi=样品中属于第i种的个体的比例，如样品总个体数为N，第i种个体数为ni，则Pi=ni/N； 各种之间，个体分配越均匀，H值就越大。如 ...

# 下载最新版QIIME 2 docker pull qiime2/core:2017.7 # 测试是否安装成功 docker run -t -i -v $(pwd):/mnt/hgfs/2017 qiime2/core:2017.7 ...

1、数据准备 现在我们常用的就是这种格式的数据，每个样品一对数据文件 数据来源：https://docs.qiime2.org/2019.7/tutorials/importing/ 2、将数据转换为qza格式（qiime新定义的自己的格式类型，有点编程中对象的含义 ...

简单理解一下内聚和耦合。 什么是模块 模块就是从逻辑上将系统分解为更细微的部分，分而治之。 复杂问题因为复杂性的问题，比较难解决，但是可以将复杂问题拆解为若干简单问题，逐个击破地解决这些简单问题，最后实现解决复杂问题的效果。 模块的粒度划分可大可小，可以是函数，类或功能块等等。 耦合主要 ...

模块独立性： 　　指每个模块只完成系统要求的独立子功能，并且与其他模块的联系最少且接口简单。 　　两个定性的度量标准――耦合性和内聚性。 耦合性也称块间联系。 ...

模块 模块是由一组语句组成，并且被标识符组成的边界元素所界定。类，方法都是可以称之为一个模块。 内聚与耦合 内聚是指一个模块内的交互程度，耦合是指模块间的交互程度。我们需要尽力做到高内聚低耦合。 内聚： 内聚分为如下几类 ...

对样品OUT抽平是为了让各样品的序列数保持一致,便于在同一标准上对各样品进行Alpha多样性分析等,保证有可比性。 Diversity parameters were estimated from OTU and functional gene matrices that were ...