在python中將一個文件的某列替換另一個文件的某列

因為我們測序的時候，引物用的是hg19作為參考序列的，但是就目前來說，hg38注釋信息更為豐富。因此，我們決定將call出來的hg19的snv位點轉化為hg38,進而用annovar進行注釋。 之前 ...

用Annovar注釋非人類基因組，如小鼠mm9

annovar一般只包含人類基因組注釋數據庫，其他的物種如小鼠需要自己進行建立注釋信息。 第一步：下載annovar軟件上Annovar官網下載（http://annovar.openbioinfo ...

[bio] STAR 通用超快的RNA aligner

rna call varients時gatk推薦工具，broad institute都推薦了，還是encode計划時冷泉港內部開發的，特點：超級快速（8min map完6gb的reads）、as支持性 ...