先寫簡略版，以后再詳細寫。 1. 對輸入結構進行預處理（refine） $> relax.default.linuxgccrelease -in:file:s input_files/ ...

安裝RoseTTAFold完成后，進入example目錄測試建模時，報錯如下： 由於psipred運行錯誤導致預測二級結構出現錯誤，也不能繼續向下執行。 解決方法如下： 1. 首先 ...

時間不充分，簡單記錄下自己實踐過程中的做法: 1. 首先，非標准殘基都需要轉換成.params文件，使用 <path-to-Rosetta>/main/source/scripts/py ...

在執行多線程編譯rosetta時執行: 　　python scons.py bin mode=release extras=mpi -j8 編譯安裝rosetta 會出現錯誤sh: mpiCC c ...

1. 下載RoseTTAFold $ git clone https://github.com/RosettaCommons/RoseTTAFold.git (100M) ...

想起什么來寫什么吧。 整體流程（以Ceas2, TPP, G3P為例）： 准備蛋白即配體參數文件(pdb文件需要有header，header的順序符合cst block的順序，且residue1和 ...