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bioMart進行基因id的轉換

1.bioMart包的介紹 bioMart包是一個連接bioMart數據庫的R語言接口,能通過這個軟件包自由連接到bioMart數據庫,這個包可以做以下幾個工作: 1.查找某個基因在染色體 ...

Tue Dec 17 23:40:00 CST 2019 0 9191
網頁工具KOBAS進行KEGG富集分析

KOBAS的介紹 KOBAS是北大生物信息中心研發的一個網頁工具,用來基因/蛋白功能注釋(注釋模塊)和功能基因集富集(富集模塊)。以下是KOBAS的英文介紹: KOBAS 3.0 is a web ...

Sat Jan 04 21:32:00 CST 2020 0 5837
GO分析-GOseq的使用教程

GOseq的介紹 GOseq是一個R包,用於尋找GO terms,即基因富集分析。此方法基於 Wallenius non-central hyper-geometric distribution。相 ...

Tue Dec 31 06:11:00 CST 2019 0 2892
edgeR之配對檢驗分析差異基因的使用教程

edgeR的介紹 背景 RNA-seq表達譜與生物復制的差異表達分析。 實現一系列基於負二項分布的統計方法,包括經驗貝葉斯估計,精確檢驗,廣義線性模型和准似然檢驗。 與RNA-seq一樣,它可用於 ...

Wed Dec 18 21:50:00 CST 2019 0 803
liftover-基因坐標的轉換

liftover的介紹 人類基因組有不同的版本,目前用的最多的是hg38和hg19,為了將不同版本的染色體上的位置一一對應,UCSC出了這款工具liftOver,官方的定義是: This tool ...

Wed Dec 11 05:51:00 CST 2019 0 361

 
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