利用ONT測序檢測真核生物全基因組甲基化狀態
摘要 甲基化在真核生物基因組序列中廣泛存在，其中5mC最為普遍，在真核生物基因組中也有發現6mA。捕獲基因組中的甲基化狀態的常用技術是全基因組甲基化測序（WGBS）和簡化甲基化測序（RRBS），而隨着第三代測序技術的完善，ONT單分子納米孔測序可以從單分子的角度來檢出甲基化的胞嘧啶和腺嘌呤電流 ...
原文：綜述：如何研究植物基因組DNA羥甲基化（5hmC）？｜易基因
大家好，這里是專注表觀組學十余年，領跑多組學科研服務的易基因。 概述： 基因表達模式的變化可能是由於在DNA序列不變的情況下基因組發生的修飾而引起的 這些修飾包括胞嘧啶甲基化生成 甲基胞嘧啶 mC ，從而產生可遺傳的表觀突變和新的表觀等位基因。這種類型的非序列變異稱為表觀遺傳學。哺乳動物中負責產生這種DNA修飾的酶被命名為DNA甲基轉移酶 DNMT ，包括DNMTI DNMT 和DNMT 。這些修 ...
2022-04-12 14:28 0 617 推薦指數：
相關推薦
一文讀懂：八大RNA m6A甲基化研究核心問題｜易基因
大家好，這里是專注表觀組學十余年，領跑多組學科研服務的易基因。 近年來，RNA m6A甲基化作為國家自然科學基金表觀遺傳學研究的熱門領域，相關研究產出呈爆炸式增長，高分文章不斷。本期，易基因通過對什么是RNA甲基化、m6A甲基化是否可逆、m6A甲基化的識別、m6A甲基化修飾的功能 ...
動物基因組與植物基因組基本差異
植物vs動物總結版： 簡述高等植物基因組（可以以擬南芥和水稻基因組為例）與高等動物基因組（可以以人類、果蠅等基因組為例）在基因結構層面展示出來的基本差異。 高等植物基因組與高等動物基因組在基因結構上的基本差異主要是生命組學的第一困境，即復制-轉錄負載困境。 機制： 1.從平衡流 ...
DNA甲基化
一、DNA甲基化簡介 1 、概念：DNA甲基化是一種重要的表觀遺傳，是指DNA被化學小分子修飾的一種方式，即甲基（-CH3）共價結合到脫氧核糖核苷酸上，可以不改變脫氧核糖核苷酸序列而引起基因表達的的改變。 2 、發生位點：真核生物常見的甲基化位點有CpG（最主要）、CHG（H指A/T/C ...
DNA甲基化
。 在哺乳動物中，DNA甲基化對於正常發育必不可少，而且與很多生物學現象有密切聯系，包括基因組印跡，X染 ...
【GS文獻】基因組選擇在植物分子育種應用的最新綜述（2020）
目錄 1. 簡介 2. BLUP類模型 3. Bayesian類模型 4. 機器學習 5. GWAS輔助的GS 6. 雜交育種 7. 多性狀 8. 長期選擇 9. 預測准確性評估 10. GS到植物育種 11. 未來展望 ...
【GS文獻】植物全基因組選擇育種技術原理與研究進展
目錄 1. 優勢雜交育種預測 2. GS育種原理與模型算法 嶺回歸和LASSO回歸 貝葉斯方法 GBLUP和RRBLUP 偏最小二乘 ...
構建一個近乎完整的植物基因組
。三代和物理圖譜提供了新機會，單倍型定相、結構變異分析、從頭泛基因組研究成為新興組裝熱點。 植物基因 ...