長鏈非編碼RNA(lncRNA) 轉自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_909da11301010bkz.html 長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉錄本長度超過 ...
基本問題: RNA的起源 定位和意義 明確RNA的各種概念分類 各種RNA的基本結構和功能 意義 有一種學說:RNA是生命的起源。 先有雞 DNA 還是先有蛋 蛋白質 ,好像都不太可能,那有沒有可能先有RNA 橋接了DNA和蛋白質,RNA本身也是一種酶。 分類 首先按是否coding,分coding RNA和non coding RNA Coding RNAs generally refers t ...
2021-12-15 13:49 0 813 推薦指數:
長鏈非編碼RNA(lncRNA) 轉自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_909da11301010bkz.html 長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉錄本長度超過 ...
RNA的重要調控功能發現歷程(Rinn et al. Annu Rev Biochem, 2013) 長非編碼RNA,英文名為long noncoding RNAs,縮寫為lncRNA,是指長度大於200 核苷酸的非編碼RNA。LncRNA因具有非常重要 ...
單細胞轉錄組確實是利器,但我們大多只利用了表達的信息,而從reads到表達之間的信息完全被我們忽略了。 最近nature發了一篇單細胞方法類文章,講得就是如何利用RNA velocity來做細胞發育路徑的推斷。 velocyto velocyto-notebooks RNA ...
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 隨着ome為詞尾的各種組學的出現,轉錄組學已經成為了人們了解生物信息的一個重要組成部分。人們使用了許多辦法來掌握轉錄組的情況,主要分為兩類,一類是基於雜交,一類是基於下一代測序技術 ...
一個比原版更好用的RNA velocity分析工具:velocyto GitHub:https://github.com/velocyto-team/velocyto.R readthedoc:http://velocyto.org/velocyto.py/index.html 歷史 ...
單細胞測序 RNA velocity | RNA速率 RNA velocity:the time derivative of the gene expression state—can be directly estimated by distinguishing between ...
在提取生物總RNA的過程中,被提取的RNA主要包含三類——rRNA,tRNA,和mRNA。 無論是在真核生物細胞中還是在原核生物細胞中,80%-85%的RNA都是rRNA,即核糖體RNA,是組成核糖體的主要成分。 原核生物的核糖體所含的rRNA有5S rRNA、16S rRNA、23S ...
ERCC的調研 在RNA-seq數據分析中,為了比較不同樣本、不同基因之間的表達差異,通常會對數據進行標准化轉化,得到RPKM/FPKM/TPM等指標。但是這些指標都是相對定量,相對定量有兩個前提:1是絕大多數的gene表達量不變;2是高表達量的gene表達量不發生改變。 可是在一些比較特殊 ...