在提取生物總RNA的過程中，被提取的RNA主要包含三類——rRNA，tRNA，和mRNA。
無論是在真核生物細胞中還是在原核生物細胞中，80%-85%的RNA都是rRNA，即核糖體RNA，是組成核糖體的主要成分。
原核生物的核糖體所含的rRNA有5S rRNA、16S rRNA、23S rRNA三種。
真核生物的核糖體所含的rRNA有5S rRNA、5.8S rRNA、18S rRNA、28S rRNA四種。
從真核生物中提取到的RNA大部分都是大片段的18S rRNA、28S rRNA，而5S rRNA、5.8S rRNA、tRNA由於分子量較小，所以比較難回收到。
如果5S RNA位置的條帶亮度很高，則表示18S rRNA、28S rRNA出現降解。
為什么RNA容易降解呢？
首先，RNA是單鏈結構，不像DNA雙鏈結構那么穩定。其次，無論是內源性的RNA酶還是外源性的RNA酶都非常多，且活性強。
RNA酶（RNase）是一種內切核糖核酸酶，可以在C和U殘基位置特異性降解單鏈RNA。RNA酶是一種小分子的蛋白，且結構中具有二硫鍵，因此非常穩定，熱變性后可以很快恢復構象。
RNA酶是生物進化出的一種防御機制，用來防御外源RNA的入侵。外源RNA的轉錄和翻譯會給細胞帶來致命性的傷害。因此，生物都分泌出大量的RNA酶，如人體的唾液、眼淚以及皮膚表面都布滿了RNA酶，被接觸過的物體上也存留着穩定的RNA酶。
因此，在提取RNA的過程中要注意嚴格防止RNA酶的降解。
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