原文:泛基因組分析方案

目錄 一 研究內容 .比較基因組分析 . 核心基因 非必需基因分析 泛基因組大小模擬 核心基因 非必需基因功能富集 核心基因 非必需基因保守性分析 核心基因 非必需基因與重復序列相關性分析 核心基因 非必需基因表達水平分析 .結構變異分析 SVs特征分析 核心 非必需SVs累計分析 圖形結構基因組構建 SVs對基因結構的影響 SVs對基因表達的影響 二 技術策略 樣本選擇 測序策略 備注:本文主 ...

2021-07-22 23:30 0 279 推薦指數:

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比較基因組分析

上的,各自具有不同的表達調控模式。基因家族的鑒定,是進化分析很重要的一個方面; OrthoMCL(htt ...

Sat Mar 24 21:05:00 CST 2018 2 8163
基因家族收縮和擴張分析 & Selective loss pathway & 基因組

套路 這通常就是基因組組裝后的必做分析,通過比較基因組學的手段進行分析,可以知道所研究物種在進化過程中哪些核心基因家族發生了變化,從而導致了其特殊的適應性機制的形成。 參考: Extremotolerant tardigrade genome and improved ...

Tue Jan 17 21:07:00 CST 2017 0 4354
第二代無創胎兒基因組分析結果

第一代無創產前診斷是通過染色體倍數異常來判斷的,最典型的就是先抽取孕婦的外周血,提取游離DNA,通過高通量測序技術分析每染色體片段,判斷胎兒是否是21號三倍體。第二代無創產前診斷分析的是基因突變診斷。 最新這篇文章通過針對母體血漿DNA進行全基因組測序(195×和270×單倍體基因組覆蓋),探索 ...

Sat Nov 05 00:54:00 CST 2016 1 1476
基因組測序及分析

基因組測序: 濃度>=50ng/ul OD260/280:1.8-2.0 DNA兩次需要量>=3ug 宏基因組測序需要提供什么樣品要求? (1)提供環境微生物的基因組DNA或者擴增產物,OD值在1.8 ...

Wed Aug 02 05:39:00 CST 2017 0 1129
GWAS全基因組關聯分析

出處:bilibili 關聯分析(Association):在交易數據、關系數據或其他信息載體中 ...

Sun Jun 13 23:55:00 CST 2021 0 4672
基因組分箱軟件metaWRAP報錯記錄與解決方法

最近學習微生物宏基因組分箱(binning),按官方文檔安裝metaWRAP,踩了一堆坑,記錄一下報錯及解決方法: 1. metaWRAP安裝 安裝教程及下載地址:GitHub - bxlab/metaWRAP: MetaWRAP - a flexible pipeline ...

Mon Nov 29 02:14:00 CST 2021 0 2123
基因組共線性分析工具MCScanX

軟件簡介 MCScanX工具集對MCScan算法進行了調整,用於檢測共線性和同線性區域,還增加了可視化和下游分析。。MCscanX有三個核心工具,以及12個下游分析工具。 軟件安裝 進入官網http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm,下載安裝 ...

Tue Mar 17 20:54:00 CST 2020 0 3218
 
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