第二代無創胎兒基因組分析結果


第一代無創產前診斷是通過染色體倍數異常來判斷的,最典型的就是先抽取孕婦的外周血,提取游離DNA,通過高通量測序技術分析每染色體片段,判斷胎兒是否是21號三倍體。第二代無創產前診斷分析的是基因突變診斷。

最新這篇文章通過針對母體血漿DNA進行全基因組測序(195×和270×單倍體基因組覆蓋),探索無創性產前檢測的限制范圍。研究人員結合一系列生物信息學篩選,完成了高於之前報道兩個數量級的陽性預測值檢測胎兒新發突變。

並且研究人員在一個CFC綜合征案例中無創發現了一個新發BRAF突變,CFC綜合症主要出現在心臟方面,包括肺動脈狹窄、瓣膜發育不良等,通常病患沒有眉毛和眼睫毛,其指甲呈現發育不良或生長過快,這一綜合征的致病基因屬於RAS-ERK訊息傳遞路徑中的成員。

研究人員指出胎兒母系遺傳可以通過全基因組分析確定,而無需母體單倍體信息,從而極大的增加了此類分析的分辨率。這些研究表明血漿DNA 片段末端(胎兒或母體篩選)的某些基因組位點可能存在重復報道。

設想母親在某個基因的某個位置上的核苷酸是Aa, 如果胎兒的是致病的aa型。那么,考慮到胎兒的DNA在孕婦的血液中只占5%. 通過對孕婦的外周血的超高通量測序(1000倍覆蓋),如果測出來A占了42.5%, a占了47.5%,我們就可斷定胎兒的基因型是aa. 這里的關鍵是測序深度要非常高,1000X。

Second generation noninvasive fetal genomeanalysis reveals de novo mutations, single-base parental inheritance, andpreferred DNA ends. 

                                                              ----------------上述內容摘自測序中國。

 

如果技術上能進一步突變,那無創產篩會得到質的飛躍。

 


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