目錄 研究一：G19833組裝，2014NG 研究二：BAT 93組裝，2016 genome biology 菜豆屬（Phaseolus L.）為同源二倍體作物，包含有80 多個物種，多數為野生種，僅有5 個栽培種，分別為普通菜豆（P. vulgaris ...

目錄 一、來源 二、結果 測序組裝 組裝評價 編碼基因預測 基因功能注釋 非編碼RNA注釋 假基因預測 重復序列注釋 進化分析和分歧時間估計 全基因組復制 LTR插入時間估計 ...

目錄 來源 一、簡介 二、結果 基因組組裝 重復序列和轉座子 基因組特征和基因注釋 綠豆的馴化 豆科基因組復制歷史 基於轉錄組分析的豇豆屬形成 綠豆育種基因組資源 三、討論 四、方法 ...

基因組注釋主要包括四個研究方向：重復序列的識別；非編碼RNA的預測；基因結構預測和基因功能注釋。我們將分別對這四個領域進行闡述。 1 重復序列的識別。 1.1 重復序列的研究背景和意義：重復序列可分為串聯重復序列（Tendam repeat）和散在重復序列 ...

目錄 一、前沿概述 二、主要結果 重測序、組裝與注釋 泛基因組 SV特征 PAV與古多倍化，WGD事件 基因SV與基因融合 SV與大豆馴化 SV影響基因表達及其與性狀關聯 一、前沿概述 ...

參考基因組版本命名參考基因組聯盟（Genome Reference Consortium），它是由 NCBI，EBI，桑格研究所等機構組成。GRC 利用最佳的技術裝配，糾正，增加基因組序列，以此作為在生信分析領域作為參考的基因組。人基因組官名叫 GRCh38 （Genome ...

植物vs動物總結版： 簡述高等植物基因組（可以以擬南芥和水稻基因組為例）與高等動物基因組（可以以人類、果蠅等基因組為例）在基因結構層面展示出來的基本差異。 高等植物基因組與高等動物基因組在基因結構上的基本差異主要是生命組學的第一困境，即復制-轉錄負載困境。 機制： 1.從平衡流 ...

NextDenovo 是有武漢未來組團隊開發出來用於組裝ONT，Pacbio, HIFI (默認參數可對60-100X數據更有效)，可通過correct--assemble對其進行組裝。組裝后， ...