如何根據fasta快速統計基因組大小及其各染色體長度？
基因組長度 利用seqkit統計長度 結果如下： sum_len總長度 各條染色體 利用pyfaidx 或者利用samtools建立的索引 結果 這里把gap也算進去了。如果不想統計，就自己寫個腳本吧。 https://pypi.org/project ...
原文：如何快速將參考基因組拆分為各條染色體序列？
目錄 需求 方法一 方法二 需求 客戶反映，完整的基因組太大打不開，要我將之按各條染色體和scaffold拆分。如何快速實現 方法一 借助工具： 方法二 自己寫腳本：split.pl 運行：perl split.pl sequences.fa 放到一個目錄中，gzip r dir一並發給客戶。 https: www.biostars.org p http: seqanswers.com foru ...
2021-04-28 17:05 0 314 推薦指數：
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