原文:用網絡圖展示富集分析

這期推文的封面是一張富集分析的網絡圖,來自文獻:Single cell RNA sequencing of human liver reveals distinct intrahepatic macrophage populations,算是比較新穎的富集展示方法,是用Cytoscape做的。 之前我介紹過一個網頁工具,可以做富集結果的網絡圖,這篇推文的閱讀量已經是我的小破公眾號關注人數的兩倍多, ...

2021-04-02 00:23 0 412 推薦指數:

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excel之富集分析制作

excel之富集分析制作 最終效果: 原始數據: 步驟: 1.數據處理 1.1 將PV數據分組,用來創建不同顏色的柱狀圖例 數據處理結果:(每類數據一列。將該列其他數據刪除后將不顯示在圖標上。) 1.2創建輔助列,用於充當折線圖的x軸,將折線圖改為縱向 ...

Wed Dec 01 03:43:00 CST 2021 0 836
Pathway富集分析氣泡

data.tsv > pathway = read.table("data.tsv",header = T, sep="\t") > library(ggplot2) ...

Tue Sep 19 00:07:00 CST 2017 0 5458
什么是網絡圖(Project)

《Project2016 企業項目管理實踐》張會斌 董方好 編著 名詞解釋:網絡圖…… 咦?書里沒寫? 看來張同學也不喜歡名詞解釋(猜的)哈哈哈…… 但是! 人家寫了兩種網絡圖:雙代號網絡圖和單代號網絡圖。 雙代號傳說應用已逐漸減少,那就無視之吧。 “單代號網絡圖:這是 ...

Sun Jul 12 00:23:00 CST 2020 0 1150
網絡圖

一.結點網絡圖 二.箭線網絡圖(常用,有虛線) 結構 虛線只是為了美感,有沒有不會扣分 實線是事件和活動 一個網絡圖只能有一個終點,如果有兩個終點也要用虛線處理成一個終點 關鍵線路是天數最大的天數(總時間最長),如下1379就是關鍵線路 ...

Fri Mar 25 05:39:00 CST 2022 0 732
Python生成gexf文件並導入gephi做網絡圖分析

Gephi是一款優秀的復雜網絡分析軟件,支持導入多種格式的文件。gexf格式是Gephi 推薦的格式,基於 XML。本文是一個用python寫的簡單Demo,示例如何生成一個典型的gexf格式文件。代碼基於pygexf包(下載地址:https://github.com/paulgirard ...

Tue Aug 25 00:30:00 CST 2015 0 13870
進度網絡圖繪圖規則

目錄 一、雙代號網絡圖 1.表示方法 2.要求 3.繪圖規則 一、雙代號網絡圖 1.表示方法 1、箭線:在雙代號網絡中,工作一般使用箭線表示,任意一條箭線都需要占用時間,消耗資源,工作名稱寫在箭線的上方,而消耗的時間 ...

Sat Jan 30 01:42:00 CST 2021 0 401
使用Cytoscape畫PPI網絡圖

打開Cytoscape軟件,根據菜單導入string_interactions.tsv文件 File ----> Import ----> Network from File 會彈出下 ...

Thu Apr 04 07:10:00 CST 2019 0 2758
 
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