From: https://mp.weixin.qq.com/s/4dtXwK1KTLXndGvO5m2BEQ 單細胞測序主要涉及單細胞基因組測序和轉錄組測序兩個方面,分別針對單細胞DNA及RNA進行序列分析和比較。單細胞測序一直是科學家關注的一個熱點。單細胞基因組測序目前主要有兩種擴增 ...
什么是CNV copy number variation CNV A copy number variation CNV is when the number of copies of a particular gene varies from one individual to the next. Following the completion of the Human Genome Proj ...
2021-05-07 14:49 0 210 推薦指數:
From: https://mp.weixin.qq.com/s/4dtXwK1KTLXndGvO5m2BEQ 單細胞測序主要涉及單細胞基因組測序和轉錄組測序兩個方面,分別針對單細胞DNA及RNA進行序列分析和比較。單細胞測序一直是科學家關注的一個熱點。單細胞基因組測序目前主要有兩種擴增 ...
本,這些轉錄本分別在細胞/個體分化發育的不同階段,在不同的組織中有各自特異的表達和功能,從而極大地豐富了編碼R ...
自從2009年單細胞轉錄組測序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技術首次問世,至今已經有幾十種不同的scRNA-seq技術相繼被開發出來。在過去的十年里,單細胞轉錄組測序技術得到了蓬勃的發展,從而使得可在單細胞水平揭示全基因組范圍內所有基因的表達情況,可以更精准的開展 ...
實驗室馬上要開始做heart的單細胞空間轉錄組,需要提前了解一下基本的data。 廢話不多說,先把示例數據和教程跑一遍,找找感覺。 參考:Seurat4.0系列教程22:空間轉錄組的分析、可視化與整合 樣本制備 - 獲取高質量數據的前提 參考 ...
單細胞測序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在過去的十多年里,高通量測序技術被廣泛應用於生物和醫學的各種領域,極大促進了相關的研究和應用。其中轉錄組測序(RNA-seq)被廣泛應用於測定和描繪各類物種的基因或轉錄 ...
本次分享一篇今年2月才發表於Nature Methods的基於單細胞轉錄組數據推斷基因調控網絡的方法比較的文章,“Benchmarking algorithms for gene regulatory network inference from single-cell ...
之前寫過三篇和CNV相關的帖子,如果你做腫瘤單細胞轉錄組,大概率看過: 單細胞分析實錄(11): inferCNV的基本用法 單細胞分析實錄(12): 如何推斷腫瘤細胞 單細胞分析實錄(13): inferCNV結合UPhyloplot2分析腫瘤進化 其中,第三篇帖子里面有兩個注釋代碼 ...
Seurat是一個老牌的單細胞分析工具了(satija的力作),我之前測試過,但是沒怎么用。 最近發現這個工具又publish在了NBT上,所以很有必要看一下這篇文章。 Integrating single-cell transcriptomic data across ...