原文:genome browser | ggplot | 基因組可視化 | R | transcript | isoform

年 月 日 更新 給每個exon編排序號,方便管理 cat gencode.v .annotation.gtf grep ENSG cut f grep exon sort k uniq less S 更新:又用了一段時間,發現是真的好用,可惜就是服務器上裝不上,只能在Mac上用了。 核心代碼很少: library ggbio hg library EnsDb.Hsapiens.v ensdb ...

2021-03-05 17:57 0 301 推薦指數:

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R語言可視化--ggplot函數

上一篇說了qplot函數,現在說一下ggplot函數 本身不能實現,需要添加層才可以。ggplot2的核心函數 ...

Wed Jul 19 21:07:00 CST 2017 0 14178
genome repeat sequence | 基因組重復序列

基因組里的小寫字母的序列就是soft masking,也就是被標記的重復序列。 怎么把重復序列提取出來,保存為bed文件? 參考:Uppercase vs lowercase letters in reference genome ...

Mon Mar 26 08:00:00 CST 2018 0 935
R:ggplot2數據可視化——進階(1)

,分為三個部分,此篇為Part1,推薦學習一些基礎知識后閱讀~ Part 1: Introduction to ggplot2, 覆蓋構建簡單圖表並進行修飾的基礎知識 Part 2: Customizing the Look and Feel, 更高級的自定義圖形 ...

Tue Sep 10 00:48:00 CST 2019 0 352
R:ggplot2數據可視化——基礎知識

1 安裝 # 獲取ggplot2 最容易的就是下載整個tidyverse: install.packages("tidyverse") # 也可以選擇只下載ggplot2: install.packages("ggplot2") # 或者下載GitHub上的開發者版本 ...

Mon Sep 09 09:40:00 CST 2019 0 2151
 
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