目錄 C簡介 技術類型及區別 數據下載 基本應用 C簡介 核心理念就是把真核細胞核里的DNA三維折疊結構給測序出來，一個最經典的模型就是遠距離enhancer可以促進轉錄。 真核生物細胞核中的染色質通過折疊成高度動態 復雜的高級結構，調控基因的轉錄 復制，以及損傷修復等重要功能。理解染色質在細胞核內如何折疊，基因組的三維空間結構如何調控基因轉錄 復制和修復等生物學功能，以及探索核染色質在遺傳 發育 ...
2021-03-01 17:12 0 616 推薦指數：
RNA-seq這個工具該什么時候用？ATAC-seq該什么時候用？有相當一部分項目設計不行，導致花大錢測了一些沒有意義的數據。 還是在中心法則這個框架下來解釋，這是生物信息的核心。打開華大科技服務官網梳理一下現在到底都有些什么測序技術： 全基因組測序和重測序 - 組裝以及尋找變異 ...
染色質可及性（Chromatin accessibility）是核內大分子能夠物理接觸染色質化DNA的程度，由核小體的占據和拓撲結構以及阻礙DNA可及性的其他染色質結合因子決定。 ...
技術，實現了全基因組范圍內染色體片段間相互作用的捕獲。Hi-C 除了用於輔助基因組組裝、對已組裝的基因 ...
首先在這里先感謝我們【Bio生信學習交流群】的群友和創建此群的群主【陳博士后】。 今天解決的問題是怎么查看自己的基因組數據是哪個Genome Reference Versions。 步驟： 第一步，打開你的基因組數據bim文件（Plink格式），隨便找一個 ...
源地址 1 概述 1.1 什么是捕獲組 捕獲組就是把正則表達式中子表達式匹配的內容，保存到內存中以數字編號或顯式命名的組里，方便后面引用。當然，這種引用既可以是在正則表達式內部，也可以是在正則表達式外部。 捕獲組有兩種形式，一種是普通捕獲組，另一種 ...
基因組里的小寫字母的序列就是soft masking，也就是被標記的重復序列。 怎么把重復序列提取出來，保存為bed文件？ 參考：Uppercase vs lowercase letters in reference genome ...
1.染色質開放性測試技術 https://zhuanlan.zhihu.com/p/31924355 首先正常的DNA都是卷起來的，只有在表達時才會展開，也就是開放，術語上說就是具有可接近性，那么ATAC-seq就是測這些染色質開放性的技術。 原理： 人為地將這些DNA序列 ...
表觀遺傳 表觀遺傳的3個機制：DNA甲基化；組蛋白修飾；chromatin remodeling 開放染色質測序： 參考：https://zhuanlan.zhihu.com/p/49461012 研究目的：研究細胞的轉錄調控。 細胞的大部分時間處於 ...
