原文:高通量測序中,read、contig和Scaffold分別是什么

.什么是Reads 高通量測序平台產生的序列就稱為reads。 .什么是Contig 拼接軟件基於reads之間的overlap區,拼接獲得的序列稱為Contig 重疊群 。 .什么是Scaffold 基因組de novo測序,通過reads拼接獲得Contigs后,往往還需要構建 Paired end庫或Illumina Mate pair庫,以獲得一定大小片段 如 Kb Kb Kb Kb 兩 ...

2021-02-20 10:23 0 277 推薦指數:

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高通量測序的reads、contigscaffold什么意思?

高通量測序數據分析: 高通量測序,reads、contigs、scaffold、unigene、singleton各是什么,有什么關系? 1. 什么是read? 高通量測序時,在芯片上的每個反應,會讀出一條序列,是比較短的,叫read,它們是讀序;就是我們測序產生的短讀序列,通常一代和三代 ...

Sun Oct 11 05:24:00 CST 2020 0 2768
readcontigScaffold分別是什么

1.什么是Reads? 高通量測序平台產生的序列就稱為reads。 2.什么是Contig? 拼接軟件基於reads之間的overlap區,拼接獲得的序列稱為Contig(重疊群)。 3.什么是Scaffold? 基因組de novo測序,通過reads拼接獲得Contigs后,往往 ...

Fri Sep 06 18:36:00 CST 2019 0 336
高通量測序基本知識

是接頭,分為pcr擴增接頭和測序接頭,分別用於文庫構建和測序的引物。index是索引序列,為區分不同樣本 ...

Mon Mar 06 18:09:00 CST 2017 0 4661
測序總結,高通量測序名詞

測序總結,高通量測序名詞 主要來自 :http://mp.weixin.qq.com/s/iTnsYajtHsbieGILGpUYgQ 測序的黃金標准:一代測序了,故稱之為黃金測序高通量測序最近這幾年很火越來越火,但是世界上更多的還是一幫天天做分子克隆 ...

Tue Oct 16 05:32:00 CST 2018 0 1199
NGS基礎 - 高通量測序原理

NGS基礎 - 高通量測序原理 原創: 贔屓 生信寶典 2017-07-23 NGS系列文章包括NGS基礎、轉錄組分析、ChIP-seq分析、DNA甲基化分析、重測序分析五部分內容。 NGS基礎系列文章包括高通量測序原理,測序數據獲取和質量評估,常見文件格式解釋和轉換 ...

Sat Oct 20 02:28:00 CST 2018 0 2435
國內高通量基因測序公司成立 時間表

可以發現幾個規律: 14年之前的公司主營業務都是科技服務 14年之后成立的公司幾乎沒有奔着科技服務去的,行業開始分化,主要是做基因檢測、個人基因組、液體活檢; ...

Sat Jan 19 23:31:00 CST 2019 0 733
用FastQC檢查高通量測序原始數據的質量

本篇文章,主要參考了陽光1986的博文(http://www.dxy.cn/bbs/topic/31324367),自己測序的分析結果作為對比,加在其中了。 1.簡介 當二代測序的原始數據拿到手之后,第一步要做的就是看一看原始reads的質量。常用的工具就是fastqc (http ...

Sun Dec 27 04:09:00 CST 2015 0 6985
Reactstate和props分別是什么

【轉】https://segmentfault.com/a/1190000011184076 整理一下React關於state和props的知識點。 在任何應用,數據都是必不可少的。我們需要直接的改變頁面上一塊的區域來使得視圖的刷新,或者間接地改變其他地方的數據。React的數據 ...

Tue Apr 24 19:25:00 CST 2018 0 2450
 
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