鏈特異性轉錄組測序
鏈特異性轉錄組測序 非鏈特異性轉錄組測序信息不包含鏈方向的特征信息，對正義和反義轉錄本無法准確判斷，導致無法反映真實的轉錄情況。而鏈特異性轉錄組測序（strand-specific RNA seq）可以解決這個問題。鏈特異性建庫的方式是在合成cDNA的第二條鏈時 ...
原文：(史上最全)SNP位點與轉錄因子結合特異性數據庫：GVATdb
眾所周知，全基因組關聯分析 GWAS 發現的很多變異位點基本為非編碼，這些變異位點 要么調控基因表達 eQTL 要么影響增強子活性 要么影響轉錄因子 TF 結合特異性 要么啥也不是。 針對以上四種情況： 是否調控基因表達 eQTL 可通過GTEx https: gtexportal.org home 查詢。 是否影響增強子活性可通過之前的推文查詢：感興趣的SNP 區域上是否有增強子 轉錄因子 增強 ...
2021-02-05 20:53 0 550 推薦指數：
相關推薦
對鏈特異性建庫的理解
對鏈特異性建庫的理解 2018年07月27日 01:21:03 sixu_9days 閱讀數：650 標簽： 鏈特異性建庫LncRNA-seq 更多 個人分類： RNA-Seq ...
MIT molecular Biology 筆記11 位點特異性重組 和 DNA轉座
位點特異性重組 和 DNA轉座 視頻 https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition J.D. Watson et. al 很多重要DNA重排是由兩類重要遺傳 ...
聯合使用PrediXcan、MetaXcan基於GWAS結果預測靶基因及特異性組織的表達（又名全轉錄組分析Transcriptome-Wide AnalysisS）
和MetaXcan工具進行全轉錄組分析（Transcriptome-Wide Analysis） 該工具最大 ...
敏感性Sensitivity和特異性Specificity的說明
https://blog.csdn.net/dgyuanshaofeng/article/details/78686117 Sensitivity，我們常說“敏感性”、“靈敏性”、“召回率”或者“查 ...
Cistrome數據庫挖掘轉錄因子靶基因 | TF | target
進入http://cistrome.org/db/#/數據庫 輸入你感興趣的轉錄因子，比如HDAC1 選擇物種，以及你感興趣的cell type 點擊可以查詢”check a putative target“ 也可以下載全部的”Putative Target ...
計算二分類的特異性和靈敏度
(Sen)： Sen=TP/(TP+FN)*100% 特異性 Specificity (Spe) s ...
蛋白質序列位置特異性矩陣(PSSM)的獲取
二、下載對比數據庫 下載地址：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast ...