構建進化樹——bootstrap tests
bootstrap檢驗是什么? bootstrap檢驗即自舉法檢驗，就是放回式抽樣統計法，通過對數據集多次重復取樣，構建多個進化樹，用來檢查給定樹的分枝可信度。 自舉檢驗(bootstrapping)介紹 基因樹是對一組序列進化關系真實模式的一個估計. 說基因樹是一種估計,是因為在置換數目 ...
原文：根據VCF構建進化樹
VCF Dis，是一款計算根據vcf文件計算距離矩陣的小工具 安裝 下載后 示例文件進行簡單使用 操作 得到的結果如下所示 構建樹 在線構建 上傳距離矩陣到在線網站, FastMe . 。上傳以后，選擇Data type為Distance matrix。 然后點擊最下方的execute amp email results即可。郵箱也可不寫。 最終得到一個.nwk的文件，導入iTOl即可查看，如下 ...
2021-01-10 20:59 0 510 推薦指數：
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