如何計算每個基因的覆蓋度與深度
如何計算每個基因的覆蓋度與深度，有多種方法可以完成。如下演示使用samtools depth命令方法 1. 數據下載 1.1 Fastq文件下載 從NCBI下載Illumina Hiseq X Ten平台的RNA-Seq數據SRR7751429信息如上圖所示。 1.1.1 ...
原文：Bedtools genomecov 計算覆蓋度
簡單說明： 從 . . 版開始，bedtools使用htslib庫支持CRAM格式 除了BAM文件，bedtools默認所有的輸入文件都以TAB鍵分割 除非使用 sorted選項，bedtools默認不支持大於 M的染色體 如果沒有使用 sorted參數對染色體按編碼順序進行排序 e.g., sort k , k , n ，則必須使用 g參數輸入相同排序染色體 bedtools要求染色體命名方案在 ...
2021-01-09 11:14 0 1029 推薦指數：
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