原文:【代謝組學】3.數據分析

目錄 非靶向代謝組實驗設計 數據分析流程 .數據預處理 .數據質控 .統計分析 非靶向代謝組實驗設計 .代謝物提取,一般要求每組至少 個樣 .在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC .QC樣本與實驗樣本穿插上機,開始十個QC,結尾三個QC,中間每十個樣本穿插一個QC樣本 。 得到質譜譜圖數據經軟件處理后得到峰表。 峰表格式一般為:每行為一個m z,每列為一個樣本 數值表示該樣本中某個m z的信號 ...

2020-12-30 11:49 0 1297 推薦指數:

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代謝3.數據分析

非靶向代謝實驗設計 1.代謝物提取,一般要求每組至少10個樣; 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC; 3.QC樣本與實驗樣本穿插上機,開始十個QC,結尾三個QC,中間每十個樣本穿插一個QC樣本 。 得到質譜譜圖數據經軟件處理后得到峰表。 峰表格式一般為:每行為一個m/z,每列為一個樣 ...

Mon Dec 30 06:35:00 CST 2019 0 5963
蛋白質數據分析——(1)原理

當前,關於高通量蛋白質的研究遠不如NGS這般火熱,網上關於這方面的知識也寥寥無幾,從事這一行也有一段時間了,但還沒好好總結過。加之過段時間可能要去做培訓,所以是時候把知識點總結一下,權當復習。當然整個蛋白質研究也算紛繁復雜,不可能面面俱到,而且很多東西我也在學習當中,肯定會出現不少紕漏 ...

Thu Jul 18 06:59:00 CST 2019 1 9679
代謝】5.功能分析

目的 和轉錄或蛋白分析原理類似,目的是: 將大量的差異代謝物降維到少量的顯著富集的代謝通路,方便解釋科學問題; 從通路水平上可以更好解釋表型背后的生物原理/過程。 富集分析方法 富集分析的本質:某個代謝通路在不同的狀態下(如疾病與健康)是否發生了顯著變化? ORA富集 回答的問題 ...

Thu Jan 16 05:54:00 CST 2020 0 1747
代謝】5.功能分析

目錄 目的 富集分析方法 ORA富集 FCS富集 工具 目的 和轉錄或蛋白分析原理類似,目的是: 將大量的差異代謝物降維到少量的顯著富集的代謝通路,方便解釋科學問題; 從通路水平上可以更好解釋表型背后的生物原理 ...

Wed Dec 30 19:52:00 CST 2020 0 429
代謝實驗、質控與分析

目錄 1.實驗及質控 (1)項目流程 (2)非靶代謝質控 (3)靶向代謝質控 (4)代謝全流程質控 2.數據分析挖掘 (1)代謝組分類回顧 (2)數據預處理 (3)定量層面挖掘 ...

Wed Dec 30 19:54:00 CST 2020 0 773
轉錄數據分析思路

轉錄緊緊圍繞基因表達量和功能分析兩部分,結合生物學問題來進行數據分析。 高表達基因已經研究比較透徹,應該更多關注中低表達基因。 層次聚類的妙用: -- 全部基因——>(差異分析)——>根據趨勢挑選部分特異性基因——>功能分析; -- 功能大類聚類——> ...

Sun Jul 19 19:45:00 CST 2020 0 2013
蛋白質數據分析筆記匯總

前言 之前本來打算根據自己對蛋白質數據分析的經驗和理解寫一系列相關教程出來供復習參考,沒想到在網上查到別人已經做過了,而且筆記相當全面,從樣本處理到質譜儀原理再到數據分析等等都有提及,雖然是2016-2017年的課程,但內容並未過時,對我自己也大有益處。雖然其中一些內容有重復,但我也不想 ...

Thu Nov 07 07:24:00 CST 2019 0 2351
小白數據分析----->如何設計和分析數據指標

今天說到的這個題目,看起來有點大,不過作為游戲數據分析師,早晚都要設計和分析數據指標。在《移動游戲運營數據分析指標白皮書》(http://www.xuefenxi.com/forum.php?mod=viewthread&tid=2&extra=page%3D1)中,提煉了一些針對 ...

Fri Feb 22 01:26:00 CST 2013 2 4051
 
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