原文:scRNAseq benchmark 學習筆記

背景 把早年沒填完的坑 單細胞測序的細胞類型鑒別 給重新拾起來 其Github描述的基本情況: 作者並不對單個分類器進行說明,統一包裝在benchmark工程里,還建立了docker容器 但說明了在scripts里有封裝好的方法,可以直接讀入數據進行分類 可以使用,但是整個過程需要知道,讀全文 回顧文章 . 文章采用的方法和數據集介紹 參考表格 個方法, 個數據集 前十一個用於數據集內比較不同方法 ...

2020-11-05 19:57 0 406 推薦指數:

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什么是 baseline 和 benchmark

  baseline 一個算法被稱為 baseline 算法說明這個比目前這個算法還差的已經不能接受了,方法有革命性的創新點可以挖掘,且存在巨大提升空間和超越benchmark的潛力,只是由於發展初期導致性能有限。所以baseline有一個自帶的含義就是“性能起點 ...

Sun Sep 12 01:14:00 CST 2021 0 209
FIO Benchmark

一、簡介 FIO為Linux kernel的IO部分維護者axobe開發, Github: https://github.com/axboe/fio。FIO的詳細使用方法參見自帶的HOWTO文件。 FIO一種IO系統的Benchmark和壓力測試工具,可以模擬不同IO場景下的IO ...

Mon Mar 13 23:04:00 CST 2017 0 3280
Google benchmark

Google benchmark 1.測量開發的某一段代碼的性能; 2.開發性能測試程序 reference: https://github.com/google/benchmark.git https://blog.csdn.net/Tornado1102/article ...

Fri Feb 18 22:41:00 CST 2022 0 851
學習筆記1

  參加工作一年多了, 但是總覺得技術沒有什么長進,最近出去面試,總結出的面試的問題。開始面試的是一家小公司,問了項目的用的技術,我說了的git、maven、springMVC,mybatis, 以 ...

Mon Oct 10 17:09:00 CST 2016 7 435
scRNA-seq數據獲得(R包scRNAseq

R bioconductor中的scRNAseq數據包是專門提供scRNA-seq數據的包。 1.Introduction scRNA-seq包提供了一個方便的途徑來獲得公開的數據集,這些數據集是以SingleCellExperiment 格式存儲的。 查看表達數據矩陣: 2. ...

Thu Jan 07 01:21:00 CST 2021 0 629
 
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