GWAS中的名稱概念
基因: 基因型: 單倍型 二倍體： 等位基因： 雜合體: 純合體: 同源染色體： 連鎖不平衡: 基因分型: 次等位基因頻率MAF: 參考：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/docs ...
原文：GWAS summary數據中SNP的rsid匹配
SNP的rsid匹配 在處理 Nealelab 中的summary data sets時，發現數據缺失SNP對應rs號： 可以看到數據中只有variant變量，這里提供了解決方案：https: www.biostars.org p ，實踐一下 Getting Started 首先下載對應的SNP注釋信息 Common SNPs All SNPs: 在R中讀取數據 下載了全部的數據以防萬一，VCF數 ...
2020-10-18 20:33 0 518 推薦指數：
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GWAS 全基因組關聯分析 | summary statistic 概括統計 | meta-analysis 綜合分析
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Post-GWAS: eQTL、mQTL共定位分析(Summary-data-based Mendelian Randomization,SMR)
1、eQTL、mQTL共定位分析的作用 eQTL、mQTL共定位分析屬於Post-GWAS的一項重要工作，旨在GWAS結果的基礎上鑒定與表型相關的eQTL和mQTL位點。 傳統的GWAS是將全基因組范圍內的常見變異進行關聯分析，鑒定與表型相關的基因座，但鑒定出來的位點大多數位於基因間隔區 ...
GWAS 匯總數據庫大全
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Summary: Java中函數參數的傳遞
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