原文:【3】腫瘤基因組數據分析方法概述

目錄 腫瘤基因組分析 腫瘤標准分析 高級分析 腫瘤數據庫 腫瘤基因組分析 腫瘤進化過程 基本概念:germline somatic driver passenger mutation 二次打擊學說:生殖突變 體細胞突變 主要基於體細胞突變研究 發展趨勢:小樣本WES 大樣本多組學 液體活檢,免疫療法,人工智能,微生物 腫瘤標准分析 腫瘤研究整體流程 測序策略:WGS,WES,WXS 目標區域捕獲 ...

2020-08-25 09:46 0 948 推薦指數:

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《全基因組測序WGS數據分析——1.DNA測序技術》學習筆記

WGS(Whole Genome Sequencing) 指將物種細胞里面完整的基因組序列全部DNA,檢測並排列,此技術幾乎能夠鑒定出基因組上任何類型的突變。 對於人類來說,全基因組測序的價值是極大的,它的信息包含了所有基因和生命特征之間的內在關聯性,當然也意味着更大的數據解讀 ...

Tue Jun 29 19:59:00 CST 2021 0 161
基因組數據分析原始數據到變異數據(Fastq->VCF)

WGS數據分析目的:檢測出每個樣本基因組中的變異集合(不同樣本中的差異序列)WGS數據分析流程分為三步:原始數據質控 -> 數據預處理 -> 變異檢測1.原始數據質控階段:拿到原始測序數據 -> QC過濾低質量的read數據2.數據預處理階段:read比對 -> sort ...

Sat May 30 06:20:00 CST 2020 0 771
R語言基因組數據分析可能會用到的data.table函數整理

版權聲明:本文為博主原創文章,轉載請注明出處 R語言data.table包是自帶包data.frame的升級版,用於數據框格式數據的處理,最大的特點快。包括兩個方面,一方面是寫的快,代碼簡潔,只要一行命令就可以完成諸多任務,另一方面是處理快,內部處理的步驟進行了程序上 ...

Sat Mar 25 05:56:00 CST 2017 0 6474
《全基因組測序WGS數據分析——1.DNA測序技術》學習筆記WGS

WGS(Whole Genome Sequencing) 指將物種細胞里面完整的基因組序列全部DNA,檢測並排列,此技術幾乎能夠鑒定出基因組上任何類型的突變。 對於人類來說,全基因組測序的價值是極大的,它的信息包含了所有基因和生命特征之間的內在關聯性,當然也意味着更大的數據解讀 ...

Fri Jul 02 02:01:00 CST 2021 0 204
[原]基因組變異檢測概述

考慮到cnblog不適合基因組領域這種類型的文章,進過多番折騰,終於用jekyll+github搭了個獨立博客www.huangshujia.me,現在博客已經搬遷! 首先,在開始之前我覺得有必要稍微科普緩沖一下,以便不使得不熟悉生物信息或基因組的客官們疑惑。O(∩_∩)O! 1. ...

Sun Sep 29 08:19:00 CST 2013 5 3582
基因組共線性分析方法

#===================================== 版本1 ================================== 鏈接地址:http://chib ...

Tue Nov 28 01:49:00 CST 2017 0 4061
python 數據分析概述

一、數據分析概念: 廣義的數據分析包括狹義數據分析數據挖掘。 ①狹義的數據分析是指根據分析目的,采用對比分析、分組分析、交叉分析和回歸分析分析方法,對收集的數據進行處理與分析,提取有價值的信息,發揮數據的作用,得到一個特征統計量結果的過程。 ②數據挖掘則是從大量 ...

Mon Jul 22 05:49:00 CST 2019 0 1083
 
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